2.6 پولیسیچرائڈ میٹابولزم اور جمع سے متعلق ڈی ای جی کا تجزیہ

سسٹانچے صحرابنیادی طور پر مشتمل ہےگلوکوز ، گیلیکٹوز ، فریکٹوز ، ریمنوز ، عربیونوز ، اور مینوزاس کے بڑے monosaccharides کے طور پر. یہ مونوساکرائڈس بذریعہ کیٹالیسس سے گزرتے ہیںglycosyltransferasesاور ترکیب کے ل other دوسرے انزائمزسسٹانچیپولیسیچرائڈس۔

 

سسٹانچے صحرا

 

اس مطالعے نے تجزیہ کیاپولیسیچرائڈ میٹابولزم کے راستےاوران راستوں میں افزودہ ڈیگسمیںسسٹانچے صحرامختلف میزبان پودوں سے۔ مندرجہ ذیل کے تجزیہ کے ذریعےکیگ راستے، پولیسیچرائڈ بائیو سنتھیسیس میں شامل کلیدی خامروں اور جینوں کی نشاندہی کی گئی تھی:

گیلیکٹوز میٹابولزم (KO00052)

مینوز اور فریکٹوز میٹابولزم (KO00051)

امینو شوگر اور نیوکلیوٹائڈ شوگر میٹابولزم (KO00520)

نشاستے اور سوکروز میٹابولزم (KO00500)

کل13 پولیسیچرائڈ بائیو سنتھیسس سے متعلق انزائمزاور کئی اہم انزائم جینوں کی نشاندہی کی گئی ، جن میں:

-امیلیس (بام)

گلوکوز -1- فاسفیٹ اڈینیللٹرانسفریز (GLGC)

ہیکسوکینیز (HK)

-فرکٹوفورانوسیڈیس (SACA)

سوکروز فاسفیٹ ہائیڈرولیس (ایس پی پی)

گلوکوز -6- فاسفیٹ isomerase (GPI)

UDP-Glucose dehydrogenase (UGDH)

mannose -1- فاسفیٹ گانلیٹرانسفریز (GMPP)

گیلیکٹینول سنتھیس (گولز)

-galactosidase (lacz)

mannose -6- فاسفیٹ isomerase (MPI)

UDP-glucuronate decarboxylase (UXS)

پائروفاسفیٹ پر منحصر فاسفوفروکوکینیس (پی ایف پی)

یہ انزائمز میں اہم کردار ادا کرتے ہیںبائیو سنتھیسسسسٹانچیپولیسیچرائڈس.

A درجہ بندی کا کلسٹرنگ ہیٹ میپڈی ای جی ایکسپریشن ڈیٹا کا استعمال کرتے ہوئے تیار کیا گیا تھاdeseq2. نتائج نے دکھایااہم فرقجین کے اظہار کے درمیانہالوکسلون-سسٹانچیاور atriplex-سسٹانچی. خاص طور پر:

ہالوکسلون-سسٹانچینمائشنمایاں طور پر اعلی اظہارکےساکا ، ایچ کے ، اور لاکز.

atriplex-سسٹانچینمائشنمایاں طور پر اعلی اظہارکےیو جی ڈی ایچ ، جی ایم پی پی ، اور گولز.

سسٹانچے صحرا

 

2.7 QRT-PCR توثیق

تصدیق کرنے کے لئےٹرانسکرپٹوم تسلسل کے اعداد و شمار کی وشوسنییتا, QRT-PCRاستعمال کرتے ہوئے انجام دیا گیا تھاایکٹ بی(-actin) بطور aہاؤس کیپنگ جین. چھکلیدی انزائم جینمیں شاملسسٹانچیپولیسیچرائڈ بائیو سنتھیس کو تصادفی طور پر توثیق کے لئے منتخب کیا گیا تھا۔

QRT-PCR کے نتائج کا اظہار اس طرح کیا گیا تھالاگ (ایف سی)اور دکھایا کہمختلف میزبان ماخوذ میں ڈی ای جی کے اظہار کے نمونےسسٹانچیٹرانسکرپٹوم تسلسل کے نتائج کے مطابق تھے:

جی ایم پی پی ، پی ایف پی ، اور یو جی ڈی ایچ کو اپ گریڈ کیا گیا تھا.

لاکز کو گھٹا دیا گیا تھا.

ان نتائج سے تصدیق ہوتی ہےٹرانسکرپٹوم ڈیٹا کی اعلی وشوسنییتا، میں مختلف جین اظہار تجزیہ کی درستگی کی حمایت کرتے ہیںسسٹانچے صحرا.

3 بحث و مباحثہ

سسٹانچے صحراکا ایک بارہماسی دواؤں کا پودا ہےorobanchaceaeکنبہ اس کی وجہ سےمنفرد نمو کا ماحولاوراعلی دواؤں کی قیمت، یہ کے نام سے جانا جاتا ہے"صحرا کا جنسنینگ۔"اس کیبایوٹک مرکباتبنیادی طور پر شامل کریںفینیلیٹھانائڈ گلائکوسائڈز ، فلاوونائڈز ، پولی ساکرائڈس ، اور بیٹین[9]۔ فی الحال ، اس دواؤں کے پلانٹ پر تحقیق بنیادی طور پر مرکوز ہےفعال اجزاء اور فارماسولوجیکل اثرات، جبکہ مطالعے میںجینیاتی سطحمحدود رہیں۔ خاص طور پر ، وہاں موجود ہیںکچھ رپورٹسپرمیٹابولک اختلافات کا جینیاتی تجزیہمیںپولیسیچرائڈس ، فلاوونائڈز ، اور فینیلیٹھانائڈ گلائکوسائڈز.

این آر ڈیٹا بیس تشریحUnigenes کے اس نے اشارہ کیاسسٹانچے صحرا، جوایک حوالہ جینوم کی کمی ہے، سب سے زیادہ قریب سے متعلق ہےپالونیا۔ تشریح شدہ یونجینز کے مختلف اظہار تجزیہ کی نشاندہی کی گئی14،089 نمایاں طور پر مختلف انداز میں جین (DEGs). اس سے پتہ چلتا ہے کہکے ٹرانسکرپٹومسسسٹانچے صحراپرجیویہالوکسیلون اموڈینڈروناورatriplex Cansensensاہم اختلافات کی نمائش کریں، امکان کی وجہ سےمیزبان پلانٹ میٹابولزم میں تغیراتاورrhizosphere مائکروبیل کمیونٹیز [11].

میںکیگ ڈیٹا بیس, 3،998 Unigenesمیپڈ کیا گیا تھا117 میٹابولک راستے، جن میں1،386 ڈگسسے متعلق راستوں میں افزودہ تھےپولیسیچرائڈس ، فیٹی ایسڈ ، امینو ایسڈ ، اور فلاوونائڈز کا بائیو سنتھیسس. یہ جین مختلف میں شامل ہیںکی میٹابولک مصنوعاتسسٹانچے صحرااور ریگولیٹ کریںپولیساکرائڈس اور فلاوونائڈز کا جمع. میں اختلافاتمختلف میزبان پودوں میں ڈگ افزودگی کے نمونے اور اظہار کی سطحکی راہنمائی کریںحیاتیاتی افعال اور فعال کمپاؤنڈ میٹابولزم میں تغیرات [12].

اس مطالعے کی نشاندہی کی گئی20 ڈگس انکوڈنگ 13 کلیدی خامروںمیں شاملپولیسیچرائڈ بائیو سنتھیسیسمیںسسٹانچے صحراٹرانسکرپٹوم۔ یہ انزائمز اور ڈگسسوکروز ، گلوکوز ، فریکٹوز ، اور گیلیکٹوز سے ماخوذ پولیساکرائڈس کے بائیو سنتھیسس میں کلیدی عمل کو منظم کریں. میںپولیسیچرائڈ سے متعلق میٹابولک راستےبشمولکہکشاں میٹابولزماورنشاستے-سوکروز میٹابولزم، کلیدی خامروں جیسےلاکز ، ساکا ، بام ، ایچ کے ، ایس پی پی ، اور یو جی ڈی ایچشناخت کیا گیا تھا۔

میںہالوکسیلون-پرجیوینگسسٹانچے صحرا،SACA ، HK ، اور LACZ کے اظہار کی سطحنمایاں تھےاعلیمیں سے زیادہatriplex-پرجیوینگسسٹانچے صحرا.

اس کے برعکس ،یو جی ڈی ایچ ، جی ایم پی پی ، اور گولز کے اظہار کی سطحنمایاں تھےاعلیمیںatriplex-پرجیوینگسسٹانچے صحرا.

ٹرانسکرومیٹک مطالعات پودوں کی نشوونما ، نشوونما ، اور ثانوی میٹابولائٹ بائیو سنتھیسیس اور جمع کے بارے میں گہری بصیرت فراہم کرتے ہیں[13]۔ پچھلے مطالعات نے تجزیہ کرنے کے لئے ٹرانسکرومیٹکس کا استعمال کیا ہےپولیسیچرائڈ بائیو سنتھیسیس راستےمیںکوڈونوپسس پیلوسولا ، پوریا کوکوس ، لائسیم باربرم ، ڈیوسکوریا مخالف ، پولیگوناٹم سیبیریکم ، پولیگوناٹم سائرونیما ، اور ڈینڈروبیم آفیسینیل[14]۔ مزید برآں ، مطالعہ کے لئے ٹرانسکرومیٹک تکنیک کا بڑے پیمانے پر اطلاق کیا گیا ہےآلو ، خربوزے اور ملبریوں میں کاربوہائیڈریٹ میٹابولزم [15-16].

مثال کے طور پر:

جی ایٹ ال۔[17] کے مابین ارتباط کا تجزیہ کیاپولیسیچرائڈ جمع اور ٹرانسکرومیٹک خصوصیاتمختلف میںکے ؤتکوںکوڈونوپسس پیلوسولا. انہوں نے پایاسوکروز -1- fructosyltransferase (1- sst) اور فروٹان -1- exohydrolase (1- feh)، کلیدی خامروں میں شامل ہیںفرکٹن بائیو سنتھیسیس، تھےجڑوں میں انتہائی اظہار کیا گیا، یہ تجویز کرتے ہیں کہ یہ خامروں ہیںپرائمری ریگولیٹرزکیمیں اعلی پولیساکرائڈ موادکوڈونوپسس پیلوسولاجڑیں، جیسا کہ HPLC تجزیہ سے تصدیق شدہ ہے۔

تاؤ ایٹ ال۔[18] منعقد کیاٹرانسکرپٹوم ترتیبشناخت کرنے کے لئےکلیدی انزائم جیناثر اندازپولیسیچرائڈ موادتین مختلف میںپولیگوناٹم پرجاتیوں (پی کنگیانم, پی سیبیریکم، اورپی سیرٹونیما) انہوں نے پایا-فرکٹوفورانوسیڈیس (ایس ای سی اے) اظہارتھامثبت طور پر باہمی تعلق ہےکے ساتھپولیسیچرائڈ مواد، اور وہساکاحصصساختی اور فعال مماثلتکے ساتھfructosyltransferases، اسے بنانا aپولیگوناٹیم پرجاتیوں میں پولیسیچرائڈ تغیر کو متاثر کرنے والے کلیدی عنصر.

لیو ایٹ ال۔[19] مشترکہٹرانسکرومیٹک اور میٹابولومکسکیوں دریافت کرناٹیٹراپلائڈڈینڈروبیم آفیسینیلڈپلومیڈ سے زیادہ پولساکرائڈ مواد ہےڈینڈروبیم آفیسینیل. ان کے مطالعے سے یہ انکشاف ہوا ہےسی ای ایس اے/سی ایس ایل ، میٹھا ، اور بی جی ایل یو جین فیملیزتھےنمایاں طور پر upregulatedمیںٹیٹراپلائڈ پودے، اس کی نشاندہی کرناان DEGs کے اعلی اظہار میں پولساکرائڈ جمع میں اضافہ ہوا.

ما ET رحمہ اللہ تعالی.[20] نے تجزیہ کیاسیل وال پولساکرائڈ بائیو سنتھیسیس کے ریگولیٹری میکانزممیںلائسیم باربرمسےچنگھائی ، گانسو ، اور ننگکسیا. چنگھائی اور گانسو کے مقابلے میں ،ننگسیا میں اضافہ ہواایل باربرمتھاسیل کی دیوار میں نمایاں طور پر اعلی کہکشاں کا مواد، امکان کی وجہ سےpectate lyase اور pectinesterase جین کا اعلی اظہار.

لو ایٹ ال۔[21] منعقد کیا گیاٹرانسکرپٹوم ترتیبتین پرپولیگوناٹم پرجاتیوں (پی سیرٹونیما, پی سیبیریکم، اورپی کنگیانم) ، تجزیہ کرناپولیسیچرائڈ بائیو سنتھیسیس راستوں میں کلیدی انزائم جین. انہوں نے شناخت کیا18 کلیدی خامروں کو انکوڈنگ کرتے ہوئے 135 ڈگس، کے ساتھ13 جین (بشمول جی ایم پی پی ، ایم پی آئی ، ایس ای سی اے ، اور فرکٹوکینیس ایس سی آر کے) جس میں اعلی اظہار کی سطح کو ظاہر کرتا ہےپولیگوناٹم سیرٹونیما.

یہ مطالعہ اس کی تفہیم کو بڑھاتا ہےپرجیوی دواؤں کے پودوں میں پولیسیچرائڈ میٹابولزمبذریعہمختلف دواؤں کے پودوں کی پرجاتیوں اور ان کے میٹابولک راستوں پر پچھلی تحقیق کی تعمیر. یہ فراہم کرتا ہے aقیمتی حوالہمیں مزید تفتیش کے لئےمیزبان پر منحصر دواؤں کے پودوں میں پولیساکرائڈ میٹابولزم کے ریگولیٹری میکانزم [22].

فی الحال ،پر اعلی تھروپپٹ ترتیب دینے کی تحقیقسسٹانچے صحراٹرانسکرپٹوم اپنے ابتدائی مراحل میں رہتا ہے. اس مطالعے کا انعقاد aجامع جین اظہار تجزیہکےسسٹانچے صحرادو مختلف میزبان پودوں پر پرجیوی اورپولیسیچرائڈ میٹابولزم میں شامل کلیدی انزائم جینوں کی نشاندہی کی. یہ نتائج ہیںاہم مضمراتکے لئےنئے میزبان پودوں کا انتخاب اور تشخیصسسٹانچے صحرااورپولیساکرائڈ بائیو سنتھیسیس کے سالماتی ضابطے اور جینیاتی بہتری کے سالماتی ضابطے کا مطالعہ کرنے کے لئے ایک نظریاتی بنیاد فراہم کریںسسٹانچے صحرا.