ملٹی فیکٹوریل سیروپروائلنگ ڈسیکٹ کرتا ہے پہلے سے موجود انسانی کورونا وائرس کا SARS-CoV-2 مدافعتی ردعمل کا حصہ (حصہ 2)

مزید معلومات کے لیے plz رابطہ کریں۔david.wan@wecistanche.com

قرارداد کی وقتی اینٹی باڈی حرکیات کی طرف سے ABCORA خدمت-oprofiلنگ.  کراس-سیکشنلتجزیہ کی اینٹی باڈی ری ایکٹیویٹی پوسٹ SARS-CoV-2RT-P کے ذریعے تشخیصسی آر (N = 369) اوربعد از آغاز کیعلامات (N = 333) انڈر لائن دی صلاحیت کی ABCORA خدمت- oprofiSARS-CoV کے آغاز، چوٹی، اور زوال پذیری کو الگ کرنا-2 اینٹی باڈی جوابات (انجیر. 5a, b، ضمنی تصویر 11)۔ افراد میں کے ساتھ a جانا جاتا ہے تاریخ کی fiپہلا SARS-CoV-2 RT-PCR تشخیص یا علامات کا آغاز، ABCORA 2.3 کا پتہ لگاتا ہے۔ایڈ جلد seroconvert-سیون میں 98 فیصد (48کی 49) اور100 فیصد (9کی 9) کی افراد کے اندر7 دن RT-PCR کے بعد اور علامات کا آغاز بالترتیب۔ اس کے علاوہ آئی جی ایم اور آئی جی اے ری ایکٹیویٹی، آئی جی جی کے جوابات آسانی سے قابل شناخت تھے۔ ABCORA 2۔{1}} انفیکشن کے کچھ دنوں کے بعد (ضمیمہاینٹریانجیر. 11a).

ایک گروہ کی طولانی تشخیصکی صحت یاب مریض اوپرکو  11  انفیکشن کے بعد کے مہینے (120 پر 251 پیمائش مریض)  روشنی ڈالیدیوقتیحرکیاتکی SARS-CoV-2 پابند اینٹی باڈیز. ہم نے زوال کا اندازہ لگایاf پابند رد عمل ملازمت aطاقت کا قانون مخلوط ماڈل اور ایک اہم کی نشاندہی کی۔ reduعمل میں آر بی ڈی, S1, اور N میں تمام آئی جی ذیلی قسمیں (انجیر. 5b) کے ساتھآدھی زندگی رینج سے 67 کو 404 دن، IgG N ٹائٹرز کے زوال پذیر ہونے کے ساتھ سب سے تیز،میںلائنکے ساتھپچھلے   رپورٹس10.   نصف-زندگیکیدی غیر جانبدارiزیشن متعلقہ آئی جی جی جوابات کو آر بی ڈی اور S1 تھے 125 اور بالترتیب 404 دن۔ حیرت انگیز طور پر، غیر جانبدار کرنے کی حرکیات اینٹی باڈیز کیا نہیں آئینہ دی زوال شرحیں پابند کرنے کے لئے مشاہدہ کیا اینٹی باڈیز غیر جانبداری کی سرگرمی اوورہ میں کمی آئیll پر a سستشرح, کے ساتھ a نصف-991 دن کی زندگی (تصویر5c)۔ یہ جزوی طور پر ایک کی وجہ سے تھا۔ملا ہوارد عملپیٹرنکے ساتھکچھافراددکھا رہا ہےایکاضافہ میں غیر جانبداری سرگرمی پوسٹ مثبت سارس-CoV-2 RT- پی سی آر5، جبکہ دوسروں میں غیر جانبداری کی سرگرمی تیزی سے بوسیدہ ہوگئی (ضمنی تصویر 11c)۔

اثرات کی ایچ سی وی قوت مدافعت پر سارس-CoV-2 حصول. کو

پہلے سے موجود کے درمیان باہمی انحصار کی تحقیقات کو فعال کریں۔ng immاتحاد کو ایچ سی او وی اور سارس-CoV-2 انفیکشن, ہم توسیع دیABCORA مالا اینٹیجن صف کو شامل S1 پروٹین کی تمام چار گردش  HCoVs  (ایچ سی وی-این ایل63,  ایچ سی وی-229E، HCV-HKU1،HCV-OC43) (Suضمنی انجیر. 12a). کے مطابق کو اس کاصلاحیت کو مانیٹر اینٹی باڈیز کو five کورونا وائرسز، ہم قرار دیا پرکھ ABCORA 5.0 اور تربیت یافتہ اور تصدیق شدہ یہ پر دی اسیگروہ کے طور پر ABCORA 2.0 (انجیر. 1)۔ کے ساتھ براہ راست موازنہ کرنے کی اجازت دینے کے لیے ABCORA 2.0 اوردیاستعمال کریں غیر جانبدارانہ پیشن گوئی کے ماڈلز کے، ہماستعمال کیا جاتا ہے دی دہلیز-/ABCORA 2 کی SOC پر مبنی تجزیہ کی ترتیبات۔{2}} بھی کے لیے ABCORA 5.0. پر مبنی پر ABCORA 5۔{1}} کی پیمائش تربیت گروہ I–III, ہم وضع کیا دو بے ترتیب جنگل-پر مبنی تجزیہ ماڈلز. اینکورا 5.4 شامل صرف دی 12 سارس-CoV-2 پیرامیٹرز، اور ABCORA 5.5 شامل ہیں۔d میںاضافہ دی  S1  ایچ سی او وی پیمائش شامل کرنا مجموعی طور پر 24 پیرامیٹرز تک۔ سے مشابہت میںABCORA 2.3, شامل کرنا کی ایچ سی وی رد عمل میں دی ماڈلتھا فائدہ مند. اینکورا 5.5 نے سب سے زیادہ حساسیت فراہم کی۔ اورمخصوصfiشہر کے درمیان دی تجزیہ الگورتھم تحقیقات ABCORA 5.0 (ضمنی تصویر 12b، ضمنی جدول 10)۔

کے درمیان باہمی انحصاراینٹی باڈی  رد عمل  کو  دی  چار HCoVs اور SARS-CoV-2 آئینہ دار کیا ہم پہلے مشاہدہ کیا

کے لیے HKU1 کے ساتھ a خاص طور پر اعلی ارتباط کی آئی جی ایم رد عمل کی

سارس-CoV-2 اور HCoVs میں پری-عالمی وباء افراد، خاص طور پر میںوہکے ساتھحالیہ  ایچ سی وی  انفیکشن  (ضمنیتصویر 13)۔ HCV انفیکشن اکثر ہوتے ہیں لیکن موسم کے تابع ہوتے ہیں۔اوردیپھیلاؤ کی انفرادی ایچ سی وی انفیکشن luctuates41,42. لائن میں اس کے ساتھ، HCV ردعمل کا پھیلاؤ ABCORA کے ذریعہ ماپا جاتا ہے۔ 5.0 میں مقامی خون عطیہ دہندگان میں جنوری 2019 (N = 285), مئی  2019   (N=288)، اور جنوری 2020 (N=252) مختلفکافی حد تک  (انجیر. 6). کو فعال a وقت-کنٹرول کا موازنہ ایچ سی وی رد عمل کے درمیان سارس-CoV-2-متاثرہ اور صحت مند عطیہ دہندگان, ہم اسکرینڈ خون عطیہ دہندگان سے مئی 2020  (N = 672), کب سارس-CoV-2 پھیلاؤ تھا زیورخ میں تخمینہ 2 فیصد سے کم، سوئٹزرلینڈ43, کی طرف سے ABCORA 2.{{0}}/5.0 اور اس کے ساتھ تمام نمونے خارج کردیئے گئے۔ سارس-CoV-2 رد عمل. دی بقایا مئی 2020گروہ (N=653)تشکیل دیا a عالمی وباء, صحت مند ڈونر اختیار گروپ دلچسپ بات یہ ہے کہ2019 اور 2020 میں HCV ری ایکٹیویٹی پیٹرن میں فرقered کافی حد تک کے طور پر اندازہ لگایا کی طرف سے ایک-راستہ انووا, جنوری 2020 کے ساتھتقابلی طور پر سب سے کم اور مئی 2020 دی سب سے زیادہ آئی جی اے اور آئی جی جیرد عملity, کونسا ہو سکتا ہے اشارہ کریں a بعد میں آغاز کی ایک ایچ سی وی وبا 2019 کے مقابلے 2020 میں (مئی 2020 کے ٹی ٹیسٹ بمقابلہ دیگر گروپسکس طرح میں انجیر. 6).

سب سے زیادہ دلچسپ بات یہ ہے کہ وقت سے مماثل تجزیہ comپارنگ مئیSARS-CoV-2-مثبت مریضوں کے نمونے کے ساتھ 2020 صحت مند عطیہ دہندگانlایڈایک ___ میںپریل, مئی، اور جون 2020 (N = 65) نازل کیا نشانیfiآسانی سے کمایچ سی وی رد عمل میں سارس-CoV-2 مثبت مریض (انجیر. 7a). یہ پیٹرن تھا بھی واضح کب ہم شامل کرنے کے لیے تجزیہ کو بڑھایا دیمکملگروہکی سارس-CoV-2  متاثرہ افراد کی پیمائشکے ساتھ  ABCORA  5.0 (N=389، نمونہ مارچ 2020 سےفروری  2021,  ضمنی  انجیر. 14)۔ مجموعی طور پر، یہ نتائج میںdicated کہ پری-موجودہ مدافعتی جوابات کو HCoVs ہو سکتا ہے کو a مخصوص ڈگری SARS-CoV-2 انفیکشن سے تحفظ فراہم کرتی ہے۔iپر.

Cistanche کے بارے میں مزید جاننے کے لیے یہاں کلک کریں۔

انجیر. 5 نگرانی وقتی ارتقاء کی اینٹی باڈی جوابات. ایک ABCORA 2.3 تعریف کی seropositivity میں عطیہ دہندگان کے ساتھ مثبت RT-پی سی آر تصدیق شدہ سارس- CoV-2 انفیکشن اور معلوم RT-PCR تاریخ (N = 369). سیرپوزیٹیٹی درجہ بندیکے بارے میں پلازما نمونے لینے وقت نقطہپوسٹ تشخیص ہے دکھایا گیا. سرمئی سایہ دار علاقہ جھلکیاں دی پہلا سات دن جب سے مثبت RT-پی سی آر پتہ لگانے. bطاقت کا قانون ماڈل, کے ساتھ وقت جب سے RT-پی سی آر کے طور پر طے شدہ اثر اور انفرادی طور پر ایک بے ترتیب اثر کے طور پر, تخمینہ لگانا دی زوال کی ABCORA 2 کی بنیاد پر اینٹی باڈی بائنڈنگ سرگرمی۔251 پیمائشاین ٹی ایس. جامنی لائنیں مطابقت کو دی ماڈل کی تخمینہ اورجامنی رنگ کے سایہ دار علاقوں کو دی95 فیصداعتماد وقفے. اینٹی باڈی نصف-زندگی (t1/2 دنوں میں) سے اہم ماڈلز ہیں دکھایا گیا. اہمیت تھا اندازہ لگایا استعمال کرتے ہوئے سیٹرتھویٹ قربت کے لیے a دو-رخا t-پرکھ پر دی ڈھال پیرامیٹرز. c پاور قانون ماڈل, کے ساتھ وقت جب سے RT-پی سی آر کے طور پر طے شدہ اثر اور انفرادی کے طور پر a بے ترتیب اثر, تخمینہ لگانا دی زوال کی غیر جانبدار کرنا صلاحیت پر 251پیمائش سے 120 افراد. صرف افراد کے ساتھ این ٹی50 > 100پر ان کا پہلا پیمائش تھے استعمال کیا جاتا ہے کو تخمینہ دی نصف-زندگی. دی جامنی لائن مماثل ہے کو دی ماڈل تخمینہ اور دی جامنی سایہ دار رقبہ کو دی95 فیصداعتماد وقفے. اہمیت تھا اندازہ لگایا استعمال کرتے ہوئے سیٹرتھویٹ کا تخمینہ کے لیے a دو-رخا t-پرکھ پر دی ڈھال پیرامیٹرز.

انجیر. 6 موسمی اور سالانہ flبیانیہ میں ایچ سی وی رد عمل. رد عمل کو انسان کورونا وائرسز (ایچ سی وی-این ایل63, ایچ سی وی-229E, ایچ سی وی-HKU1, ایچ سی وی-او سی43)تھا موازنہ کی طرف سے ABCORA 5.0. رد عمل میں صحت مند خون عطیہ دہندگان سے 2019 اور 2020 تھا موازنہ. پری-عالمی وباء نمونے شامل: جنوری 2019 (N = 285), مئی 2019 (N = 288), جنوری 2020 (N = 252). نمونے سے مئی 2020 (N = 672) تھے جمع دوران دی عالمی وباء میں سوئٹزرلینڈ. صرف نمونے بغیر سارس-CoV-2 مخصوص رد عمل کے طور پر تعریف کی طرف سے ABCORA تھے شامل (N = 653). ستارے مطابقت کو سطح کی اہمیت کی دو-طرفہ ٹی-ٹیسٹ موازنہ دی اشارہ کیا گروپس. سطحیں کی اہمیت ہیں درست کیا کی طرف سے دی بونفیرونی طریقہ کے لیے متعدد ٹیسٹنگ اور اشارہ کیا کے طور پر پیروی کرتا ہے:        *p< 0.05/36، **p < 0.01/36,="">p< 0.001/36۔باکس پلاٹس نمائندگی دی درج ذیل: اوسط کے ساتھ دی درمیانی لائن, اوپری اور کم چوتھائی کے ساتھ دی ڈبہ حدود, 1.5x interquartile حدود کے ساتھ دی سرگوشیاں اور باہر کرنے والے کے ساتھ پوائنٹس.

اثرات کی  ایچ سی وی  قوت مدافعت میں  سارس-CoV-2  انفیکشن.  کو

HCV استثنیٰ کے ساتھ باہمی انحصار کو مزید دریافت کریں، ہم نہیں کرتےxtتحقیقات کی چاہے ایچ سی وی جوابات ہیں منسلک ارتقاء کوکی سارس-CoV-2 اینٹی باڈیز. کو یہ آخر میں، ہم نے اینٹی باڈی کا تجزیہ کیا۔نمونے لینے والے 204 افراد کے پلازما میں جواباتمیں 60 SARS-CoV کے بعد کے دن-2لکیری ریگریشن ماڈل کا استعمال کرتے ہوئے تشخیص مثبت RT-PCR، اور HCV کے بعد سے عمر، جنس اور وقت کے لیے ایڈجسٹرد عمل. کو سطح بندی ایچ سی او وی رد عمل میں اعلی اور کم HCoV سرگرمی, اوسطلاگ MFI-FOE تھے ڈیfined کے لیے ہر ایک ایچ سی وی اوراینٹی باڈیکلاس LogMFI-FOE متعلقہ سے زیادہ ہے۔کم از کم کے لئے درمیانیt تین HCoVs (HKU1, او سی43, این ایل63, یا 229E) ایک مخصوص میںc آئی جی کلاس تھے درجہ بندی کے طور پر ہونا اعلی ایچ سی وی سرگرمیاس کلاس کے اندر سب سے پہلے، ایک ہی مخالف کے درمیان صرف رد عملbاوڈیکلاس ورe دریافت کیا میں دی ماڈل (i.e., ایچ سی وی آئی جی جی اعلی پر سارس- CoV-2 IgGs)۔ ہم نے استثناء کا مشاہدہ کیا۔llyمضبوطباہمی انحصار کے لیے آئی جی اے اور آئی جی ایم جوابات SARS-CoV-2 کو، جوتمامتھےنشانیfiآسانی سےاعلیمیںافرادکے ساتھاعلی ایچ سی ویرد عمل (انجیر. 7b). یہ سختی سے تجویز کرتا ہے کہ پہلے سے موجود HCV استثنیٰ فراہم کر سکتا ہے۔e ایک فائدہ میں بڑھتے ہوئے سارس-CoV-2 جوابات.HCV IgG اور SARS کے درمیان باہمی انحصار CoV-2  مخصوص IgG صرف S2 ردعمل کے لئے مشاہدہ کیا گیا تھا۔ حیرت انگیز طور پر، اس تلاش کی حمایت کرتے ہوئے، HCV S2 hایلپر جواباتتھے حال ہی میں پایا کو فروغ سارس-CoV-2 قوت مدافعت, میںخاص S2 اینٹی باڈی سرگرمی31. یہ جاننے کے لیے کہ آیا SARS-CoV-2 IgG ہو سکتا ہے۔تعمیر پر حالیہ ایچ سی وی آئی جی اے اور آئی جی ایم جوابات ہم اگلے تحقیقاتآیا HCV IgM اور IgA ele سے منسلک ہیں۔vated سارس-CoV-2 مخصوصfic  آئی جی جیسطح.جبکہ IgM کے لیے کوئی اثر ظاہر نہیں ہوا، ہم ایک نشانی کا مشاہدہ کیاifiنہیں کر سکتے ایسوسی ایشن کی اعلی ایچ سی وی آئی جی اے سرگرمی پرتمامچارماپا  سارس-CoV-2  جوابات  (انجیر.  7c,  d). یہ سختی سے تجویز کرتا ہےکہحالیہ  ایچ سی وی  انفیکشن ہےa فائدہficial بڑھتے ہوئے SARS-CoV-2 اینٹی باڈی ردعمل پر اثرses.

میں دی اگلے تجزیہ, ہم تحقیقات اگر پری-موجودہ ایچ سی وی قوت مدافعتہے ایک COVID- 19 میں بیماری کی شدت پر اثر۔ اس مقصد کے لئے، ہمتحقیقات ایچ سی او وی قوت مدافعت میں 80 اسپتال میں داخل اور غیر اسپتال میں داخلافراد متاثرہ کے لیے 30 دن سے کم (تصویر.8a)۔ کے لیے کنٹرول کرنا عمر اور جنس، ہم نے پایا کہ ہائے والے افرادgh پری-موجودہ HCV کی رد عمل کی اہمیت تھی۔چیونٹیکم  ڈی ڈی ایسکوضرورت ہےہسپتال میں داخل  (لاجسٹکرجعت  یا = 0.16، 95 فیصد CI (0.04، 0.67)، تصویر۔8b، ضمنی شکل 15)۔ ایک مزید سٹراٹifiکیشن کیpمریض کی طرف سے چاہے وہ کی ضرورت ہے علاج پر ایک آئی سی یو دکھایا a امکان کم ہے کہ مریضts کے ساتھ اعلی ایچ سی او وی جواب مطلوبہ شرح ہسپتال میں داخل کے ساتھ شدید دیکھ بھال (عام رجعتیا {{0}}.36، 95 فیصد CI (0. 13، 0.96)، تصویر۔8ب، سپلیمنٹریFig. 15). اس طرح, افراد کے ساتھ اعلی ایچ سی او وی سطح تھا a 64 فیصد امکانات کم ہوئے۔ یا کے مطابق ہسپتال میں داخل ہونے کی ضرورت ہے۔دنال درجہ رجعت تجزیہ موازنہ ہسپتال میں داخل میں باقاعدہ وارڈز, میں آئی سی یو، اورغیر ہسپتالd افراد   (انجیر.  8a,  b).   اجتماعی طور پر,  یہ مشاہدات سختی سے ایک کراس حفاظتی اثر تجویز کرتے ہیں۔of ایچ سی ویسارس کے خلاف مدافعتی دفاع کی تشکیل پر استثنیٰCoV-2.

انجیر. 7 اثرات کی پری-موجودہ ایچ سی وی قوت مدافعت دوران سارس-CoV-2 حصول. a وقت-مماثل موازنہ کی ABCORA 5.0 رد عمل کے لیے سارس-CoV-2اور HCoVs میں صحت مند اور سارس-CoV-2 متاثرہ افراد. صحت مند عطیہ دہندگان تھے نمونہ میں مئی 2020 (N = 653; نیلا). پلازما سے سارس-CoV-2     متاثرہ فردs تھا جمع کے درمیان اپریل–جون 2020 (N = 65; سرخ). دیکھیں ضمنی انجیر. 14 کے لیےایکتجزیہ کی دی مکمل سارس-CoV-2 مثبت گروہ(N = 389). سرمئی بکس اشارہ کریں اقدار اوپر دی انفرادی ایم ایف آئی-FOE کاٹنا-بند کے لیے سارس-CoV-2 مخصوص جوابات کے لیے ہر ایک اینٹیجن. ستارے مطابقت سطحوں تک کی اہمیت کی دو-رخا t-ٹیسٹ موازنہ منفی بمقابلہ مثبت مریض. سطحیں کی اہمیت ہیں درست کیا کی طرف سے دی بونفیرونی طریقہ ایک سے زیادہ کے لئے ٹیسٹنگ اور اشارہ کیا کے طور پر پیروی کرتا ہے: *p< 0.05/12، **p< 0.01/12، ***p< 0.001/12 (آئی جی جی HKU1: p = 0.66, آئی جی جی او سی43: p = 0.45، IgG NL63: p=3۔3 × 10−04، آئی جی جی 229E: p = 1.6 × 10−05, IgA HKU1: p=1.8 × 10−03, IgA OC43: p=1.3 × 10−05, IgA NL63: p=1.4 × 10−07, IgA 229E: p=3۔{2}} × 10−05, IgM HKU1: p = 3.3 × 10−08, آئی جی ایم او سی43: p = 4.3 × 10−03, آئی جی ایم این ایل63: p = 1.1 × 10−07, آئی جی ایم 229E: p = 2.7 × 10−02). باکس پلاٹس نمائندگی دی درج ذیل: اوسط کے ساتھ درمیان والا لائن, اوپری اور کم چوتھائی کے ساتھ دی ڈبہ حدود, 1.5x interquartile حدود کے ساتھ دی سرگوشیاں اور باہر کرنے والے کے ساتھ پوائنٹس. b لکیری رجعت ماڈل دکھا رہے ہیں دی ایسوسی ایشن کے درمیان سارس-CoV-2 اور ایچ سی وی سگنل میں 204 سارس-CoV-2 مثبت مریض کے ساتھ جانا جاتا ہے تاریخوں کی پہلے مثبت RT-پی سی آر کا پتہ لگانا. اثر انداز ہوتا ہے۔ کے اندر دی اسی اینٹی باڈی کلاس ہیں تحقیقات کی. دی ماڈلز تھے ایڈجسٹ پر عمر (spline کے ساتھ 3 ڈگریاں کی آزادی), صنف, اس وقت سے مثبت RT-پی سی آر (spline کے ساتھ 3 ڈگریاں کی آزادی), اور سطح کی ایچ سی او وی رد عمل. نمونے ہیں ڈیزائن کیا گیا کو بندرگاہ اعلی ایچ سی وی رد عمل اگر وہ ABCORA دکھائیں۔ 5.0 ایچ سی ویلاگ MFI-FOE اقدار اعلی مقابلے دی متعلقہ اوسط میں پر کم از کم 3 ایچ سی او وی پیمائش (HKU1, او سی43, این ایل63, یا 229E). منحنی خطوط مطابقت رکھتے ہیں۔ کو دی ماڈل کی تخمینہ اور سایہ دار علاقوں کو دی95 فیصداعتماد وقفے. p-اقدار تھے حاصل کیا کی طرف سے چل رہا ہے a دو-رخا طالب علم t-پرکھ پر پیرامیٹر منسلک کے ساتھ ایچ سی وی رد عمل میں دی لکیری رجعت. c لکیری رجعت ماڈل دکھا رہا ہے دی ایسوسی ایشن کے درمیان سارس-CoV-2 آئی جی جی اور HCV آئی جی اے سگنل. منحنی خطوط مطابقت کو دی ماڈل کی تخمینہ اور سایہ دار علاقوں کو دی95 فیصداعتماد وقفے. p-اقدار تھے حاصل کیا کی طرف سے چل رہا ہے ایک دو-رخا طالب علم t-پرکھ پر دی پیرامیٹر منسلک کے ساتھ ایچ سی وی رد عمل میں دی لکیری رجعت. d لکیری رجعت ماڈل دکھا رہا ہے دی ایسوسی ایشنSARS-CoV-2 IgG اور HCV IgM سگنلز کے درمیان۔ منحنی خطوط ماڈل کے تخمینہ اور سایہ دار علاقوں کے 95 فیصد اعتماد کے وقفوں سے مطابقت رکھتے ہیں۔ p-values تھے حاصل کیا کی طرف سے چل رہا ہے a دو-رخا طالب علم t-پرکھ پر دی پیرامیٹر منسلک کے ساتھ ایچ سی وی رد عمل میں دی لکیری رجعت.

بحث کریں۔آئن

ڈیfiقوم کی  سارس-CoV-2  قوت مدافعت پوسٹ ویکسینیشن اورانفیکشن فوری اہمیت کا حامل ہے44–46. مخالف کو سمجھناجسمتعلق رکھتا ہےکی سارس-CoV-2  تحفظاورنگرانی ویکسین جوابدہی آگے چیلنجنگ کام ہیں۔ شدت and لمبی عمر کی حفاظتی اینٹی باڈی جوابات کو قدرتی انفیکشن اور مختلف ویکسینز ضرورت کو ہونا جانچ پڑتال کی کو سمجھناپیرامیٹرز کہ شکل حفاظتی جوابات اور رہنمائی کے فیصلے غیر جواب دہندگان میں دوبارہ ویکسینیشن اور دوبارہ حفاظتی ٹیکوں پرnstناول پیدا ہونے والا سارس-CoV-2 متغیرات47. اسی طرح تخلیق کا مطلب ہے۔ سیرولوجیکل طور پر ڈی نوو انفیکشن کے درمیان فرق کریں، دوبارہانفیکشن,اور ویکسین جوابات, ان کا استحکام اور ناکامیاں مرضی باقیcrاٹیکل کے لیے طبی تشخیص.

یہاں ہم مظاہرہ کرنا دی اعلی افادیت کی کثیر-پیرامیٹر خدمت- d میں کلیدی مسائل کو حل کرنے میں مؤثر طریقے سے کام کرناefiننگ  سارس-CoV-2 قوت مدافعت.  بیک وقتپتہ لگانےکی اینٹی باڈی ردعمل a رینجکی سارس-CoV-2  اینٹیجنزاورمختلف  آئی جیکلاسزکے ساتھ ABCORA  seroprofiلنگکی ایک جامع تصویر فراہم کی ایک ہی امتحان میں SARS-CoV-2 سیرولوجک حیثیت، جو can ای موجودگی کا تعین کرنے کے لیے طبی تشخیص کے لیے مفید ہو گا۔of دوبارہ انفیکشن,  ڈیfineدوبارہ انفیکشن,  اورجواب دیںکوویکسینیشن. کمپیوٹیشنلماڈلنگبھیاجازت دیپیشن گوئی پلازما نیواحساس صلاحیت سے ABCORA نتائج, چالو کرنا aوسیع تشخیص کے کی سارس-CoV-2 اینٹی باڈی حرکیات اور ان کے کے ساتھ تعاملایچ سی وی جوابات. ہم تعلیم حاصل کی دو ABCORA پرکھورژن ویںپر دونوں ماپا ایچ سی وی رد عمل ساتھ ساتھ دی  12 سارس-CoV-2 پیرامیٹرز.ANCORA 2 میں S1 کا اینٹیجن شامل تھا۔HKU1. اینکورا 5 شامل S1 کی تمام چار گردش ایچ سی وی.قابل ذکر ہے۔, کمپیوٹیشنل ماڈلز کہ شامل دی ایچ سی ویپیمائش اجازت دی a اعلی صحت سے متعلق میں تعین سارس-CoV- 2 سیروپازیٹیٹی، اعلیروشنی باہمی انحصار کے درمیان ایچ سی او ویاور سارس-CoV-2 جوابات جن کو حل کرنے کی ضرورت ہے۔

ریکارڈنگ رد عمل خلاف تمام چار HCoVs میں سارس-CoV-2غیر متاثرہ اورمتاثرہافرادہممشاہدہ کیادلچسپایسوسی ایشنز یوغیر متاثرہافراددکھایا گیااعلی  ایچ سی ویتجویز کردہ متاثرہ افراد کے مقابلے میں رد عملaشراکت کی ایچ سی وی قوت مدافعت کو جلد دفاع خلاف سارس-CoV- 2. HCV استثنیٰ SARS-CoV پر بھی مثبت اثرات مرتب کر سکتا ہے-2انفیکشن. میں معاہدہ کے ساتھ دوسرے رپورٹس, ہم نوٹ کیا aکراس فیڈنگ کی سارس-CoV-SARS-CoV-2 انفیکشن میں 2 اور HCV ردعمل31,48 کے ساتھ افراد کے ساتھ اعلی ایچ سی وی رد عمل ترقی-کھلنا اعلی سارس-CoV-2 اینٹی باڈی سطح. زیادہ تر خاص طور پر، پہلے سے موجود ایچ سی وی قوت مدافعت تھا ایک کے اثرات پر بیماری شدت ہمارے میں گروہ. سارس-CoV-2 متاثرہ افراد کے ساتھ کم HCV رد عمل تھا a اعلی امکان کی کی ضرورت ہے ہسپتال میں داخل

جبکہہمارےمطالعہمکمل طور پر ماپا اینٹی باڈی ردعمل، aممکنہ، استعدادحفاظتیاثرکی ایچ سی او ویسارس کے خلاف قوت مدافعتCoV-2 حصول چاہئے نہیں ہونا دیکھاکے طور پرمحدود کو اینٹی باڈی کی سرگرمی. اینٹی باڈیز اور سیلولر استثنیٰ دونوں متعلقہ ہو سکتے ہیں۔اور کنسرٹ میں سرگرم31,49–51. متبادل طور پر، اینٹی باڈی ردعملsesmآرام دہ میں دی موجودہ مطالعہ ہو سکتا ہے صرف دستاویز حالیہ ایچ سی وی انفیکشنn اور پہنچانا a سروگیٹ پیمائش کی دوسرے حفاظتیایچ سی وی جوابات. دی لنک کے درمیان اعلی ایچ سی وی  اور سارس-CoV-2 رد عمل متاثرہ افراد میں خاص طور پر دلچسپ ہے. مضبوط ترین اثرات تھے دیکھا کے لیے آئی جی ایم اور آئی جی اے ایچ سی او وی جوابات, sugاشارہ کرنا کہ حالیہ ایچ سی وی قوت مدافعت فراہم کرتا ہے ایک جلد فروغ کو SARS-CoV-2 اینٹی باڈی ڈیولپمنٹent.  چاہےیہہےواجب الاداکو کراس ری ایکٹیو بی سیل ردعمل جس پردی  سارس-CoV-2قوت مدافعت بناتا ہے پر اور پختہ یا چاہے کراس-رد عمل T مددگارسرگرمیاںکھیلیںایک غالب کردار جیسا کہ تجویز کیا گیا ہے۔31  ہو جائے گا اہم کو حل میں آگے-آ رہے ہیں مطالعہ. دی صحیح کردار اور وقتg کی ایچ سی او ویجواباتاثر انداز  سارس-CoV-2  اینٹی باڈیجوابات بھی باقی کو ہونا ڈیfined. جلدی کم-affinity HCoV جوابات ہو سکتا ہے ہے a مثبت کے اثرات پر دی ترقی سارس کے-CoV-2 مدافعتی میموری تشکیل دے کر جس پر کو تعمیر, جبکہ amplifiکیشن کی غیر-حفاظتیکراس رد عملایچ سی وی ایکٹائی باڈیز کے مطابق کو دی اینٹی جینک گناہ اصول ہو سکتا ہے ہے منفی اثرات30.

اگرچہایسوسی ایشنہمارے جیسے مطالعہ رسمی طور پر نہیں ہو سکتے ڈیfine وجہ, دی مضمرات کی ہمارے نتائج واضح ہیں: پہلےقوت مدافعت کو ایچ سی وی ہو سکتا ہے حفاظت کو کچھ حد تک خلاف سارس-CoV-2 حصول، اورہو سکتا ہے فراہم کریں a فروغ کو دی ترقی سارس کے-CoV-2 مخصوصfic قوت مدافعت اور کے ساتھ یہ کم دی خطرہ کے لیےشدیدہسپتال میں داخل.  A  معمولیHCoV کا حفاظتی اثرقوت مدافعت کرے گا ہونا a قابل فہم وضاحت کے لیے دی اعلیتناسبasymp کےٹماٹک اور معتدل سارس-CoV-2 انفیکشن52,53. یہاں تک کہ مزید دلچسپ مستقبل کے نقطہ نظر ہیں. دوسروں اور ہم کے طور پرہے دکھایا گیا, سارس-CoV-2 اور ایچ سی وی قوت مدافعت کو انفیکشن ہیںاکثر نہیں طویل-دیرپا (انجیر. 5, ضمنی انجیر. 11)5,54، ایک حدکہ  سارس-CoV-2  ویکسینزامیدکوقابو پانا چاہیے سارس-CoV-2  جواباتمیںموڑفراہم کریںدفاع کی ایک ڈگری HCV کے خلاف انفیکشن, وسیع تحفظ خلاف کورونا وائرسز r میں ہو سکتا ہےہر ایک.

انجیر. 8 کے اثرات کی ایچ سی او وی قوت مدافعت پر COVID-19 شدت. a ایسوسی ایشن کی ہسپتال میں داخل حالت (نہیں ہسپتال میں داخل (N = 16); ہسپتال میں داخل نہیں میں آئی سی یو(N = 42); ہسپتال میں داخل میں آئی سی یو (N = 22)) اور اعلی یا کم آئی جی جی ایچ سی او وی رد عمل. مستطیل سائز مطابقت کو دی تناسب کی شامل مریض. b کا اثر ایچ سی او وی رد عمل (کم/اعلی) پر دی ہسپتال میں داخل حالت میں a ذیلی سیٹ کی N = 80 مریض, کے طور پر اندازہ لگایا گیا کے ساتھ مشکلات تناسب, میں ایک عام رجعت (سطحوں کے ساتھ = نہیں ہسپتال میں داخل (N = 16); ہسپتال میں داخل نہیں میں آئی سی یو (N = 42); ہسپتال میں داخل میں آئی سی یو (N = 22)) اور a لاجسٹک رجعت (حوالہ = نہیں ہسپتال میں داخل(N = 16); بمقابلہ تمام ہسپتال میں داخل (N = 64)). ڈیٹا ہے پیش کیا کے طور پر پیرامیٹر تخمینہ اور اس کا95 فیصداعتماد وقفہ. سطح کی اہمیت کی پیرامیٹر ہے حاصل کیا کے ساتھ a دو-رخا t-پرکھ (p-قدر ہے دکھایا گیا اگر <>دوسری صورت میں اشارہ کیا کے طور پر n.s.).

مجھےthods

انسان نمونہ. سیرم اور پلازما کے نمونے ظہور سے پہلے اور بعد میں جمع کیے گئے تھے۔

SARS-CoV-2 inسوئٹزرلینڈ (پری اورفروری کے بعد 2020, بالترتیب) تھےشامل. نہیں صبر اندراج تھا منعقد کیا کے لیے دی موجودہ مطالعہ. تمامتجربات شامل نمونے سے انسان عطیہ دہندگان تھے منعقد کیا کی منظوری کے ساتھ جواباتقابل مقامی اخلاقیات کمیٹی (کنٹونالے۔ اخلاقی کمیشن) زیورخ,

سوئٹزرلینڈ (بی ایس ای سی Nrs 2020-01327, 2020-00363; 2021-00437; 2020-00787)، بذریعہ دی دفعات کی دی اعلامیہ کی ہیلسنکی اور دی اچھا کلینیکل مشق کریں۔ ہدایات کی ہم آہنگی پر بین الاقوامی کانفرنس نمونے تھے حاصل کیا سے درج ذیل ذرائع: (i) زیورخ خون کا عطیہخدمتes (ZHBDS): گمنام صحت مند بالغ پلازما سے پری-عالمی وباء وقتپوائنٹس (جنوری 2019, مئی 2019,اور جنوری 2020) اور پہلی لہر سے زیورخ، سوئٹزرلینڈ میں وبائی بیماری (مئی 2020) تھے فراہم کی کی طرف سے دی ZHBDS اندرونی سیرم ذخیرہ اور نقصاناتent کے لیے یہ مطالعہ تھا معاف کر دیا کی طرف سے دی اخلاقیات کمیٹی(بی ایس ای سی 2021-00437). (ii) گمنام معمول کی تشخیص سے بچ جانے والے نمونے۔ پر دی انسٹی ٹیوٹ کی طبی وائرولوجی, جامع درس گاہ کی زیورخ, دی یونیورسٹی کے بچے ہسپتال زیورخ، اور دی کینٹونل ہسپتال ونٹرتھر (بی ایس ای سی Nrs2020-01327, 2021-00437)۔ تمام شرکاء سے تحریری باخبر رضامندی حاصل کی گئی تھی۔جس کا نمونہ was لیا دوران دی عالمی وباء پر دی جامع درس گاہ ہسپتالزیورخ (بی اے ایس ای سی 2020-01327)۔ دوسرے ہسپتالوں سے وبائی امراض کے نمونوں کے لیےd پریعالمی وباء نمونے رضامندی تھا معاف کر دیا کی طرف سے دی اخلاقیات کمیٹی. (iii) صحت کی دیکھ بھالRT-PCR والے کارکنان SARS-CoV-2 سے متاثر ہوتے ہیں۔آئن حصہ لینے والا میں a مطالعہ میں جامع درس گاہ ہسپتال زیورخ (بی ایس ای سی 2020-00363). لکھا مطلع رضامندی تھی حاصل کیا سے تمام امیدوار. (iv) مرد پلازما عطیہ دہندگان حصہ لینے والا میں ایک سارس-CoV-2 پلازما تھراپی مطالعہ یونیورسٹی ہسپتال زیورخ میں کیا گیا۔(سی پی ٹی-ZHP, سوئس میڈیک 2020ٹی پی پی1004; بنیادی 2020-00787)۔ تحریری اطلاعتحقیق کے لیے تمام شرکاء سے رضامندی حاصل کی گئی۔ ٹیوہ رپورٹنگ کی تمام انسان اور پیٹیnt ڈیٹاتعمیل کرتا ہے کے ساتھدیاسٹروب بیان. پری-عالمی وباء (سارس- CoV-2 منفیve, N = 825) اور confirmed سارس-CoV-2 مثبت نمونے (N = 389)تھے تقسیم میں تربیت اور توثیق گروہ (ضمنی ٹیبل 3).          دستیاب ڈیموگرافکس data پر صنف, عمر, وقت جب سے مثبت RT-پی سی آر اورsعلامت آغاز, اور ہسپتال میں داخل حالت ہیں اطلاع دی میں ضمنی ٹیبل 11.دی سارس-CoV-2 تربیت گروہ (N = 175) کے دوران جمع کردہ پلازما شامل ہے۔انفیکشن (N=114) اور صحت یاب ہونا (N=61)۔ فی ڈیاونور صرف ایک نمونے لینے وقتپوائنٹ شامل تھا، لونgitudinal نمونے کی عطیہ دہندگان شامل میں دی تربیت گروہ تھے نہیں شامل میں دی توثیق جب آزادی کا پتہ لگانے کے لئے کوہورٹاندازہ دی حساسیت اور مختلف تشخیصی طریقوں کی خاصیت۔ دی   سارس-CoV-2 توثیق گروہ (N = 214), پر مشتمل پلازما جمع انفیکشن کے دوران (N = 90، فی عطیہ دہندہ کے لیے ایک نمونہ لینے کا ٹائم پوائنٹ) اور صحت یابی

(N = 12479 مریض جن میں 1–4 طول بلد نمونے ہیں)۔ متعدد بارپوائنٹس کی صحت یاب مریض تھے شامل میں دی کیپچر کرنے کے لیے توثیق کا ڈیٹا سیٹ ڈبلیو کا وسیع طیفaning اینٹی باڈی ٹائٹرز. ایک کراس سیکشنل تجزیہ تھا کی بنیاد پر پرنمونے کے ساتھ جانا جاتا ہے وقت جب سے مثبت RT-پی سی آر (N = 369) یا جانا جاتا ہے وقت علامت کے بعد سے آغاز (N = 333)، دونوں میں طول بلد تجزیہ مشاہدات شامل ہیں۔دونوں، مثبت RT-PCR کے بعد کا وقت اور وقتجب سے آغاز تھا جانا جاتا ہے کے لیے330 نمونےتین دن کے درمیانی وقت کے ساتھys کے درمیان علامت آغاز اور RT-پی سی آر(1st–3rdچوتھائی: 1-7 دن)۔ اینٹی باڈی ری ایکٹیویٹی کا طولانی تجزیہ پر مبنی تھا۔ 120 کنولز سے 251 مشاہدات پرسینٹ مریض کے ساتھ جانا جاتا ہے وقت جب سے مثبت RT-PCR اور علامت شروع ہونے کے بعد کا وقت۔ نیوٹرلائزیشن was ماپا پر 467 SARS-CoV-2 RT-PCRمثبت نمونے (N = 369 کے ساتھ جانا جاتا ہے وقت جب سے مثبت RT-پی سی آر, N = 333 کے ساتھ جانا جاتا ہے وقت جب سے علامت آغاز).

ہم نے کراس ری ایکٹیویٹی ABCORA 2 کا مزید جائزہ لیا۔{2}} اور 5۔{4}} بائیں میں۔t-ختم پلازماپری پینڈیمک کنٹرول گروپ ڈبلیو میں معمول کی تشخیص سےith دستاویزی, حالیہ HCV انفیکشن (تربیت II, N = 75; او سی43 (N = 27), HKU1 (N = 17), این ایل63      (N = 22), 229E (N = 9)). گردش کرنے والا ایچ سی وی ہے عام طور پر صرف اسکرینڈ کے لیے میںہسپتال میں داخل، شدید سانس کے انفیکشن اور قوت مدافعت سے سمجھوتہ افرادجو معمول کے مطابق ایک بھائی سے گزرتے ہیں۔اشتہار اسکریننگ کے لیے سانس کی انفیکشن. اس لیے, میں یہ مریض گروپ دونوں کم اینٹی باڈی رد عمل واجب الادا کو مدافعتی سمجھوتہ کرنے والا یابلند HCV antibody رد عمل واجب الادا کو حالیہ یا بار بار چلنے والا ایچ سی وی انفیکشن ہو سکتا ہےواقع. جیسا کہ یہ گروپ تشخیص ہے۔stically متعلقہ ہم سمجھا جاتا ہے یہ محتاط کو یہ شامل کریں گروہ کے طور پر تربیت II ڈیٹا سیٹ کو تصدیق کریں اگر کراس-رد عمل کے ساتھ سارس-CoV-2 میںABCORA ہوتا ہے اس ترتیب میں. ٹریننگ II کا ڈیٹا دہلیز میں شامل نہیں کیا گیا تھا۔ ڈیfiقوم کو نہیں ختم-نمائندگی افراد شدید بیماری کے ساتھ. یہ HCV سے متاثر ہے۔گروپ دکھایا گیا مجموعی طور پر کم رد عمل کے ساتھ سارس-CoV-2 سے پلازما سےصحت مند بالغوں لیکن اہم بات دکھایا نہیں اشارہ کی کراس ری ایکٹیویٹی (تصویر1a, b). وبائی مرض کا نمونہles سے گمنام خون عطیہ دہندگان کے ساتھ نامعلوم سارس-CoV-2حالت جمع میں مئی 2020 (N = 672) تھے نہیں شامل میں تربیت اور توثیق گروہ.

ری ایجنٹس اور سیل لائنز۔ اس کی ٹیبڑھا ہوا سارس-CoV-2-ماخوذ اینٹیجنز (رسیپٹر

بائنڈنگ ڈومین (RBD)، subunit S1 (S1)، subunit S2 (S2)، nucleocapsid پروٹین (N)) اور t کا S1وہ چار گردش HCoVs (HKU1, او سی43, این ایل63, 229E) تھے خریدا Sino Biological Europe Gm سےبی ایچ, Eschborn, جرمنی (ضمنیٹیبل 12)۔ ماخذ، تفصیلات، اور پتہ لگانے اور کنٹرول اینٹی باڈیز کا ارتکاز اور سیرا ABCORA اور نیوٹرلائزیشن ٹیس کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ts ہیں درج میں سپلیمنٹری ٹیبل 13. 293-T خلیات امریکن ٹائپ کلچر کلیکشن سے حاصل کیے گئے تھے۔(اے ٹی سی سی سی آر ایل- 11268)55. ایچ ٹی1080/ACE2cl. 14 خلیات33 تھے مہربانی سے پی کے ذریعہ فراہم کردہBieniasz, راک فیلر جامع درس گاہ, NY. دونوں سیل لائنیں تھے مہذب میں ڈی ایم ای ایمپر مشتملاین جی10 فیصدایف سی ایس.

ڈیزائن کی ملٹی پلیکس مالا پرکھ ABCORA 2.0. ہم قائم دو مالا-کی بنیاد پرملٹی پلیکسڈ SARS-CoV-2 immunoassays (ABCORA 2.0 اور ABCORA 5.0) کہSARS-CoV-2 اور H کی ایک رینج شامل ہے۔CoV اینٹیجنز (سینو حیاتیاتی یورپGmbH, Eschborn, Germany, ضمنی جدول 12)۔ چار SARS-CoV-2 اینٹیجاین ایس- آر بی ڈی, S1, S2, اور N - تھے شامل میں دونوں ABCORA 2.0 اور ABCORA 5.0.اینکورا 2.0 شامل میں اضافہ S1 کی ایچ سی وی-HKU1، اورABCORA 5.0 شامل S1کی تمام گردش HCoVs (ایچ سی وی-این ایل63, ایچ سی وی-229E, ایچ سی وی-HKU1, ایچ سی وی-او سی43). میں مختصر, انفرادی میگ پلیکس موتیوں کی مالا (Luminex کارپوریشن, آسٹن, TX)    Uniq کے ساتھue فلوروسینٹ مالا علاقوں تھے منتخب کیا کے لیے ہر ایک اینٹیجن, موتیوں کی مالا تھےاینٹیجن کپلڈ مالا کا جوڑا اور مرکبsتھےانکیوبیٹڈ کے ساتھ صبر پلازما میں a 96-ٹھیک ہے پلیٹ سیٹ-اوپر. دیاوسط فلوروسینٹ شدت (ایم ایف آئی) کی مالا سے منسلک پلازمااینٹی بیodies تھا ماپا استعمال کرنا a فلیکس میپ 3D قاری (Luminex کارپوریشن,آسٹن, TX). ہم ڈیزائن کیا گیا دی پرکھ کو فلfill دی درج ذیل معیار: (i) اعلی رفتار-cifiشہر, حساسیت، اور تولیدی صلاحیت, (ii) لچکدار ملٹی پلیکس ڈیزائن کہ براہ راست اجازت دیتا ہے اضافہ اور/یا تبدیلی کی اینٹیجنز; (iii) چوڑا متحرک رینج;  (iv) اختیاری مقدارfiکیشن کی اینٹی باڈی جوابات; (v) اختیاری ریکارڈنگ کیاینٹی باڈیHCoVs کے جوابات اور (vi) روٹی میں استعمالne تشخیص اور تحقیق.

ہم نے سٹریکل کا انتخاب کیا۔ واقفیت قبضہ ذریعے مخالف-اس کا اینٹی باڈیز کو یقینی بنانے a یکساں اینٹیجن ڈسپلے۔ لہذا، کاربو آکسیلیٹڈ ایمagPlex موتیوں کی مالا (Luminex

کارپوریشن, آسٹن, TX) تھے جوڑا کے ساتھ مخالف-اس کا اینٹی باڈی (سینو حیاتیاتی

یورپ GmbH, Eschborn,جرمنی، ضمنی جدول 13) اور پھر جوڑا اس کے ٹیگ کے ساتھاینٹیجنز استعمال کرتے ہوئے بایو-پلیکس امین جوڑے (بایو-ریڈ لیبارٹریزAG, Cressier, Switzerland) کارخانہ دار کے مطابق iہدایات اور کے طور پربیان کیا56.

سیرم/پلازما ٹائٹریشن کو عام طور پر سب سے درست سٹرا سمجھا جاتا ہے۔ٹیگی کوretriحوا مقداری معلومات پر اینٹی باڈی رد عمل. البتہ, میں تشخیصی استعمال کریںٹیسٹ مثالی طور پر چاہئے پہنچانا (نیم)-مقداری معلومات سے a واحد سیرمکم کرنا کو اجازت کافی تھرو پٹ۔ پرکھ کی حتمی شرائط کا احاطہ کیا گیا a 2تمام پروبڈ اینٹیجن-آئی جی کے امتزاج پر لاگ ایم ایف آئی رینج (ضمیمہ تصویر 1)۔توثیق کرنا دی درست کی استعمال کرتے ہوئے a اکیلا پلازما کم کرنا, ہم confirmed کہ پلازماسے سارس-CoV-2 مثبت مریض اور پری-عالمی وباء سارس-CoV-2منفیپلازما کے نمونے خوراک کا بہترین ردعمل ظاہر کرتے ہیں۔ منحنی خطوط ختم a چوڑا پلازما کم کرنارینج (ضمنی انجیر. 1f). اہم بات, a 1/100 کم کرنا کی پلازما تھا میں تماممقدمات بند کریں زیادہ سے زیادہ سگنل تک، اس بڑھتے ہوئے پلازما کی نشاندہی کرتا ہے۔ارتکاز سگنل کی شدت میں اضافہ نہیں کرے گا بلکہ ختم ہو جائے گا۔er کم ہو رہا ہےsignals واجب الادا کو پرو زون اثرات (ضمنی انجیر. 1f).

زیادہ سے زیادہ مخالف-اس کا اینٹی باڈی لوڈ ہو رہا ہے تھا حاصل کیا پر 5 µg اینٹی باڈی فی دس لاکھموتیوں کی مالا (ضمیمہداخلہ انجیر. 1c) اور استعمال کیا جاتا ہے کے طور پر a معیاری جوڑے حالت. میں دی finalپروٹوکول,پانچ ملین اینٹی ہز اینٹی باڈی کپلڈ میگنیٹک بیڈز لگائے گئے تھے۔ اس کا-ٹیگ اینٹیجنز پی بی ایس میں 320 این ایم کی حراستی میں پتلا۔Phycoerythrin (PE) کا لیبل لگا سیکنڈری اینٹی باڈیز IgG، I کے لیے مخصوصجی اے، یا آئی جی ایم تھےڈٹیکٹر اینٹی باڈیز کے طور پر استعمال کیا جاتا ہے (ضمنیٹیبل 13). معیار اختیار کی دیاینٹیجن لوading تھا کارکردگی کا مظاہرہ کیا کی طرف سے انکیوبٹنگ دی موتیوں کی مالا کے ساتھ مونوکلونلمتعلقہ CoV-d کو نشانہ بنانے والی اینٹی باڈیزحاصل کیا اینٹیجن کے طور پر تفصیلی میںضمنی جدول 12۔ تجزیہ عقل سے کیا گیا۔h دی فلیکس میپ 3D قاری(Luminex کارپوریشنn, آسٹن, TX) کے ساتھ دی حصول کی پر کم از کم 50 موتیوں کی مالا فیمالا کا علاقہ. نتائج aدوبارہ محفوظ شدہ کے طور پر ایم ایف آئی فی مالا علاقہ.

کنٹرول کے کئی اقدامات inst تھے۔alled کو معلوم کرناانٹر اور انٹرا-پرکھکارکردگی کم پرکھ کا پتہ لگانے کے لیے-پرکھ تغیر پذیری, بڑا بیچز کیانفرادی اینٹیجن سے بھری ہوئی bایڈز تھے تیار اور منجمد میں aliquots جب تک استعمال کیا جاتا ہے پر-20 ڈگریC کو چکر لگانادیزوال کی دی اینٹیجن-جوڑا موتیوں کی مالا (ضمنی شکل 1)۔ انفرادی جوڑے موتیوں کو ٹیسٹ کے دن yi سے ملایا گیا تھا۔بزرگ دی کی ضرورت ہے اینٹیجنمالا کاک. کاک ٹیلوں میں 60 موتیوں کی پیer مالا علاقہ فی µl. میں اضافہ کوSARS-CoV-2 اور HCV مالا کے علاقے، ہر کاک ٹیل میں ایک خالی جگہ شامل ہےy مالا کا علاقہ (نہیں اینٹیجن جوڑا) کو اختیار کے لیے غیر مخصوصfic پابند. معیار کنٹرول اور توثیق طریقہ کار کے لیے دی فلیکس میپ 3D آلہ تھے ہو گیا پر ہر ایک دن کےتجربہ اے سی سیترتیب کودیکارخانہ دار's ہدایات. دی تغیر پذیری کی دی پرکھتھا تجزیہ کیا کے طور پر پیروی کرتا ہے56: پلازما نمونے سے 20 RT-پی سی آر confirmed SARS-CoV- 2 متاثرہ مریضوں کو جمع کیا گیا اور ان کا ٹیسٹ کیا گیا۔ver a رینج کی سات dilutions میں 31  مختلف ٹیتکرار کارکردگی کا مظاہرہ کیا پر 10 مختلف دن (ضمنی انجیر. 2). اس پارتمام اینٹیجنز اور آئی جی کلاسز, سگنل تھے برقرار رکھا ختم دی پرکھ مدت کی 25دنوں کی پوسٹ مالا جوڑے. ٹی کے پار بائنڈنگ سگنل کے تغیرات کے گتانک (CV)تکرار12 antigen-Ig کلاس کومبی میں سےقومیں ثابت کم (رینج: 0.010–0. 128, اوسط  0.059، ضمنی تصویر 3c، d، ضمنی جدولیں 1، 2)۔ ایک ہی دن اور ایک ہی دنتغیر پزیرگھمایا کم اور موازنہ (ضمنی انجیر. 3e, f). نیچے a 1/ 100 پلازما توجہ مرکوز کرنا, سی وی اضافہ ہوا واضح طور پر (ضمنی تصویر 3d)         1/100 کو سب سے زیادہ ارتکاز کے طور پر بیان کرناپر (سب سے کم پلازما کم کرنا) کو ہونا تجربہ کیا میں دی پرکھ اس طرح 1/100 پلازما کی کمی کو بنیادی کے طور پر بیان کیا گیا تھا۔کم کرنا کے لیے اسکریننگ پلازما میں ABCORA 2.0 کب a قابلیت (یعنی، SARS-CoV- کی موجودگی یا غیر موجودگی 2مخصوص اینٹی باڈیز) یا نیم مقداری (یعنی MFI سگنل کی شدت) ریڈ آؤٹ ہےrمطلوبہ.

ABCORA کی تمام پیمائشیں ڈی تھیں۔rived سے اکیلا پیمائش جب تکدوسری صورت میں بیان کیا. SARS-CoV کی پیمائش کرنے کے لیے-2 مخصوصc اینٹی باڈیز میں صبر پلازما,گرمی سے غیر فعال پلازما (1 h پر56 ڈگریC) تھا پتلا 1/100 میں پی بی ایس-بی ایس اے1 فیصدجب تکدوسری صورت میں کہا. 50 µl پتلاایڈ پلازما تھے انکیوبیٹڈ کے ساتھ 50 µl کی دی ABCORAاینٹیجن مالا کاک ٹیل کے لیے 30 منٹ پر کمرہ درجہ حرارت میں 96-اچھی طرح پلیٹیں، دھویا تین بار PBS-BSA 1 فیصد کے ساتھ، اور الگ الگ رد عمل میں wiphycoerythrin (PE)-لیبل لگا ہوا پکڑنے والا اینٹی باڈیز کے لیے آئی جی جی, آئی جی اے یا آئی جی ایم پر a final حراستی کی 1/500 PBS-BSA میں 1 فیصد۔ اس کمزوری کی وضاحت پہلے کی گئی تھی۔زیادہ سے زیادہ MFI سگنل حاصل کرنے کے لیے ڈیٹیکٹر اینٹی باڈیز کا ٹائٹریشن۔ 45 میٹر کے بعدinutes کیکمرے کے درجہ حرارت پر انکیوبیشن، موتیوں کو پی کے ساتھ تین بار دھویا گیا۔BS-بی ایس اے1 فیصداور تجزیہ کیا میں 96-ٹھیک ہے پلیٹیں FlexMap 3D ریڈر پر (Luminex Corporation، Austin, TX). A کم از کم کی 50 مالا پڑھتا ہے فی اینٹیجن تھا حاصل کیا

حقیقی کراس ری ایکٹیو اینٹی باڈ کو کنٹرول کرنے کے لیےies, ہر ایک پلازما نمونہ تھابی کے ساتھ تشخیص کیا گیا ہے۔ڈی ایس بغیر اینٹیجن (خالی مالا اختیار) میں مجموعہ کونساہر ایک پکڑنے والااینٹی باڈی. کے لیے تجزیہ, خام ایم ایف آئی اقدار تھے تبدیل کو ایم ایف آئی-FOE کو درست کے لیے پس منظر پابند.ہم نے اوسط خالی مالا MFI قائم کیا-وبائی امراض سے پہلے کے صحت مند عطیہ دہندگان (N=1016) اور se کے IgG، IgA، اور IgM کے لیے FOEt مطلب ایم ایف آئی-FOEپلسخالی مالا کے کنٹرول کے لیے حد کے طور پر 4x معیاری انحراف۔میں مطلق سطح, یہ دہلیز رقم کو ایم ایف آئی-FOE 41.58 (IgG)، 55.91 (IgA)، اور 269.47 (IgM)۔Mپیمائش کے لیے کونسا دی خالی مالا اختیار محفوظ شدہ اقدار above یہ دہلیز تھے سمجھا جاتا ہے غلط اور بار بار.

ہر Luminex analysis 96- well plat conta کے لیے ترتیب دیا گیا تھا۔میں دی اسی سیٹ کیاختیار نمونے, یعنی 7 سیریل 4-گنا ایک SARS-CoV-2 مثبت کنٹرول کی کمزوریاںڈونر پول (N = 20 عطیہ دہندگان, شروع کم کرنا 1/100, ضمنی انجیر. 1f) اور ایک پری-عالمی وباء صحت مند ڈونر پول (کم کرنا 1/100, N =20 عطیہ دہندگان، سپلیمنٹریتصویر 1f)۔ یہ مثبت اور منفی کنٹرول پرکھ کی کارکردگی کو کنٹرول کرنے کی اجازت دیتے ہیں۔nceآزاد پیمائش اور اس کے علاوہ فعالسابقہاگر ضرورت ہو تو بیرونی کنٹرول کے خلاف معیاری کاریڈیڈ.

تعریف کی سارس-CoV-2 seropositivity میں ABCORA 2.0 اور ABCORA 5.0. کوSARS-CoV-2-کو مخصوص کراس ری ایکٹیو اینٹی باڈیز سے ممتاز کریں، ہم ڈیefined ایم ایف آئی- 12 SARS-CoV-2 اینٹیجنز اور Ig کلاس کے امتزاج میں سے ہر ایک کے لیے FOE کی حدs پلازما اینٹی باڈی کی بنیاد پرسرگرمی میں تربیت گروہ (ضمنی میزیں 3 اور 4)۔ ان میں پری پینڈیمک صحت مند ڈونر پیلسمہ (تربیت I, N = 573),عطیہ دہندگان کے ساتھ حالیہ ایچ سی وی انفیکشن (تربیت II, N = 75; او سی43 (N = 27), HKU1 (N = 17), این ایل63 (N = 22), 229E (N=9)) اور تصدیق شدہ SARS-CoV-2 انفیکشن والے عطیہ دہندگان (تربیت III, N = 175). دہلیز تھے سیٹ کو کم سے کمجھوٹے مثبتجبکہ یقینی بنانا حساسیت کے لیے سارس-CoV-2اینٹی باڈی کا پتہ لگانے اور ایک تک پہنچنے کے لئےمجموعی طور پر خصوصیت اوپرe99 فیصداور شامل سطح کے لیے سرحد-لائن رد عمل کے لیے آئی جی جیآر بی ڈی،آئی جی جی S1, اور آئی جی جی N کو اجازت دیں بھی معمولی اینٹی باڈی رد عمل کو یہ اینٹیجنز to ہونا جانچ پڑتال کی. ایم ایف آئی-FOE پڑھتا ہے کی انفرادی نمونے تھے تبدیل میںسگنل اوور کٹ آف (SOC) ویلیوز (MFI-FOE/threshold)۔ SOC values ہیں استعمال کیا جاتا ہے کے لیےگدھےگانا مثبت رد عمل کے لیے ہر ایک انفرادی اینٹیجن-اینٹی باڈی کلاس مجموعہ, کے ساتھ SOC > 1 مثبت رد عمل کی نشاندہی کرتا ہے، اور SOC <1 منفی رد عمل کی نشاندہی کرتا ہے۔کب ترتیب انفرادی دہلیز, یہ ضروری ہے ہونا سمجھا جاتا ہے کہ کے لیے ہر ایک کی دی 12 تحقیقات سرگرمیاں کراس رد عمل ہو سکتا ہے. 12 انفرادی SOC پیرامیٹرز کے ساتھ ریکارڈ شدہ، مجموعی رفتارcifiشہر مرضی کمی اگر کوئی بھی مثبت SOC آزادانہ طور پر suffices کو شرح a نمونہ مجموعی طور پر کے طور پر سارس-CoV-2 اینٹی باڈی مثبت. کو مثال دینا:فرض کرنا آزاد ردعمل، یہاں تک کہ ہر اینٹیجن کے لیے ایک اعلی 99 فیصد خصوصیت بھی اس میں اضافہ کرے گی۔o پوری پرکھ میں مجموعی طور پر کم 88 فیصد مخصوصیت۔ اس طرح ہمیں ضرورت تھی۔r سارس-CoV-2 مثبت کال کرنا میں ABCORA 2.0 a کم از کم کی دو مخصوصfiشہر کو پہنچسرگرمی اوپردیدہلیز مشترکہ SOC قدریں مجموعی طور پر بیان کرنے کے لیے استعمال ہوتی ہیں۔دیے گئے نمونے کے سیرو اسٹیٹس کی تفصیل ضمنی جدول 5 میں ہے۔ Ig کے لیےG آر بی ڈی, S1, اور N,جس کے لیے ہم نے بارڈر لائن SOC سرگرمی بھی ریکارڈ کی، ہم نے اجازت دی1 اینٹیجن ری ایکٹیویٹی ایس او سی > 1 کا مجموعہ، دوسری ری ایکٹیویٹی ایس او سی > بارڈر لائن. دی final دہلیز اور مثبت کال معیار اجازت دی کے لیے تفرق جزوی (جلد seroconversion کے ساتھ صرف آئی جی ایم اور آئی جی اے جوابات) کو مکمل خدمت-          تبدیلی (incلڈنگ آئی جی جی جوابات) (ضمنی ٹیبل 5). میں اضافہ, معیار کمزور رد عمل اور/یا غیر متعین رد عمل والے نمونوں کی نشاندہی کریں۔(ضمنی جدول 5)۔

موازنہ کو آسان بنانے کے لیےeen ABCORA 2.0 اور ABCORA 5.0 دی اسیدہلیز کٹ آف ABCORA 5 کے لیے استعمال کیے گئے تھے۔{2}}۔ ہم نے مخصوص کٹ آف نہ بنانے کا انتخاب کیا۔HCV اینٹی باڈی ری ایکٹیویٹی کے لیے حدیں بطور an درست ڈیfiقوم کی a منفیHCoVs اور consi کے وسیع پیمانے پر نمائش کی وجہ سے ردعمل پیچیدہ ہے۔قابل قدراینٹی باڈی کراس ریکتنگی کے درمیان انہیں. ایچ سی وی جوابات تھے البتہ شامل اعدادوشمار میںکیل تجزیہ کرتا ہے کے طور پر ایم ایف آئی-FOE اقدار.

تعریف کی سارس-CoV-2 seropositivity استعمال کرتے ہوئے لاجسٹک رجعت درجہ بندی.

کلاسیfiکیشن کی seropositive بمقابلہ seronegative نمونے میں ABCORA 2. 1 کا احساس ہوا۔استعمال کرتے ہوئےلاجسٹک رجعت. دی ایک جیسی تربیت اور توثیق ڈیٹا استعمال کیا جاتا ہے کے لیے دی قیام کی ABCORA 2.0 تھے استعمال کیا جاتا ہے. جیسا کہ دی ABCORA 2۔{1}} پابند رد عمل انتہائی باہم مربوط تھے، ہم نے ماڈل میں درج ذیل متغیرات کو شامل کیا (ضمنی انجیر. 6a): دی مطلب قدر تمام IgG MFI-FOE جوابات (RBD, S1, S2, N)، مطلب قدر کی RBD، S1، اور S2، اور اوسط کے خلاف IgA MFI-FOE ردعمل RBD، S1، اور S2 کے خلاف IgM MFI FOE ردعمل کی قدر۔ IgA اور IgM جوابs سے N کو خارج کر دیا گیا کیونکہ وہ اسی I کے دوسرے جوابات کے ساتھ کلسٹر نہیں ہو رہے تھے۔g کلاس (ضمنی انجیر. 6a)۔ لاجسٹک ریگریشن کا استعمال تخمینہ اور پیشین گوئی کے لیے کیا گیا تھا۔ دیئے گئے نمونے کا امکانe کو ہونا مثبت (p) کے طور پر بیان کیا میں مساوات (1).

پارامیٹر  0, G, A, اور  M تھے اندازہ لگایا گیا پر دی تربیت ڈیٹاسیٹ. A نمونہ اس کے بعد مثبت کے طور پر بیان کیا گیا تھا اگر اس کے مثبت ہونے کا امکان اوپر تھا۔a دہلیز c/. اس حد کی وضاحت کم از کم 0.99 اور تربیتی ڈیٹاسیٹ پر زیادہ سے زیادہ حساسیت (اسی طرح to c کے لیے دی بے ترتیب جنگل). میںخلاصہ, میں ABCORA 2. 1کسی بھی نئے نمونے کی تعریف سیرو پازیٹو کے طور پر کی جاتی ہے اگر اس کا امکان ہو۔ لاجسٹک ریگریشن کے تخمینے کے مطابق سیرو پازیٹو ہونے کا c/ سے اوپر ہے۔ ہمارا تجزیہ کرتا ہے۔re R ورژن میں کارکردگی کا مظاہرہ کیا۔n 3.6.3. تعریف کی سارس-CoV-2 seropositivity استعمال کرتے ہوئے بے ترتیب جنگل درجہ بندی.  seropositive ve کی درجہ بندیrsus seronegative نمونے میںدیخیال، سیاق کی اینکورا 2۔{1}} اور ABCORA 5۔{3}} ری ایک تھا۔liized استعمال کرتے ہوئے a بے ترتیب جنگل نقطہ نظر درج ذیل دیآر کا بنیادی سیٹ اپاینڈوم جنگلات کے طور پر بیان کیا میں57. دی بے ترتیب جنگل خود تھا تعمیر MFI-FOE ردعمل کا استعمال کرتے ہوئے 1000 درجہ بندی کے درختوں کے جوڑ کااورRBD، S1، S2 کے خلاف IgM،N). دی امکان کی a نمونہ ہونے کی وجہ سے مثبت کے طور پر پری-  بے ترتیب جنگل سے طے شدہ پی کی اوسط ہے۔robabilities ختم تمام 1000 درخت. آخر میں، ایک نمونہ defi ہےned کے طور پر مثبت اگر اس کا امکان کی ہونے کی وجہ سے مثبت ہے اوپر a تھریشوld c, کونسا ہے ڈیfined کے طور پر کو حاصل کریں a مخصوصfiشہر کی پر کم از کم 0.99 اور a زیادہ سے زیادہ ٹرین میں حساسیتing ڈیٹاسیٹ. میں خلاصہ, کوئی بھی نئی نمونہ ہے ڈیfined کے طور پرseropositive if its امکان کی ہونے کی وجہ سے seropositive کے طور پر اندازہ لگایا گیا کی طرف سے دی بے ترتیبجنگل thr سے اوپر ہے۔ایشولڈ c. ہم منعقد کیا a سیریز کی بے ترتیب جنگل تجزیہ کرتا ہے جس میں یا تو صرف SARS-CoV-2 جوابات یا SARS-CoV-2 اور HCV پر غور کیا گیا   جوابات میں ABCORA 2۔{1}} اور ABCORA 5۔{3}}: ABCORA 2.2 اور ABCORA 2.3 تھےتربیت یافتہ اور استعمال کیا جاتا ہے کے لیے پیشن گوئی پر ABCORA 2.0 ڈیٹا اور شامل صرف سارس-  CoV-2 جوابات یا سارس-بالترتیب CoV-2 اور HKU1 جوابات۔ اینکورا 5.4 (صرف SARS-CoV-2 جوابات) اور ABCORA 5.5 (SAآر ایس-CoV-2 اور ایچ سی ویجوابات) تھے تربیت یافتہ پر ABCORA 5{0}} ڈیٹا۔ کے لیے ڈیٹا کی شمولیت پر تفصیلات متعلقہ ماڈلز ہیں درج میں ضمنی ٹیبل 3 اور ضمنی ٹیبل 10. پیکیج کا استعمال کرتے ہوئے R ورژن 3.6.3 میں تجزیہ کیا گیا۔es بے ترتیب جنگل اور     رینجر58–61.

اپنے نتائج کی مضبوطی کو یقینی بنانے کے لیے، ہم نے ایک تجربہ کیا۔حساسیت تجزیہ بے ترتیب کرکے ایک 5- فولڈ کراس توثیق کا استعمال کرتے ہوئے تربیت اور توثیق کے ڈیٹا سیٹسطریقہ دونوں سیٹکی مثبت اور منفی نمونے تھے تقسیم میں five برابرحصے اور ہم ڈیfined کہ راستہ five توثیق سیٹ (پر مشتمل کی دی i-ویں سیٹ کیمثبت اوردی i-ویں سیٹ کی منفی, i = 1.5). دی آرام کی دی ڈیٹا تھا استعمال کیا جاتا ہے کے لیےتربیت دی ABCORA 2.3 بے ترتیب جنگل. ہر توثیق سیٹ کے لیے، مخصوصیت اورحساسیت کی دی بے ترتیب جنگل تھے حساب کیا پر دی تربیت, توثیق، اور تربیتپلستوثیق سیٹ (ضمنی جدول 6)۔

توثیق اور تصدیق استعمال کرتے ہوئے بیرونی کنٹرول کرتا ہے. ہم استعمال کیا جاتا ہے دی مخالف-سارس-  CoV-2 تصدیقی پینل برائے سیرولوجی اسسز (Nآئی بی ایس سی کوڈ: 20/B770, این آئی بی ایس سی) کوABCORA 2{1}} اور ABCORA 2.3 ٹیسٹ کی کارکردگی کی تصدیق کریں۔ سیرمsکافیکی دی ویریfiکیشن پینل ماپا کی طرف سے ABCORA 2۔{1}}/2.3 جیسا کہ بیان کیا گیا ہے اور نتائجNIBS کے ذریعہ رپورٹ کردہ تجارتی طور پر دستیاب اسیس کے نتائج کے مقابلے میںC (32 اور ضمنی جدول 7)۔ ہم furtاس کا ویریfiایڈ دی حساسیت کی دی ABCORA 2 پرکھ میں پتہ لگانا سارس-CoV-2 انفیکشن میں کمرشل کے ساتھ براہ راست موازنہٹیسٹ اینٹی بیاوڈی حالت کی پلازما سے سارس-CoV-2 مثبت افراد (N = 171) تجزیہ کیا گیا تھاd کے ساتھ دی درج ذیل پرکھ نظام: شامل پرکھ نظام نشانہ بنایا دی N پروٹین (الیکسیس® مخالف-سارس-CoV-2 (Roche Diagnostics GmbH)) RBD علاقہ کی دی S پروٹین (الیکسیس® مخالف-سارس-CoV-2 S Asay (Roche Diagnostics GmbH))،اور دی S1 ذیلی یونٹ (EUROIMMUN مخالف-سارس-CoV-2 ایلیسا (آئی جی جی)) (ضمنیجدول 8)۔ تمام assays کے مطابق کارکردگی کا مظاہرہ کیا گیا تھادی کارخانہ دار's ہدایات میں دی تشخیص یونٹ کی دی انسٹی ٹیوٹ کی طبی وائرولوجی, یونیورسٹی آف زیورخ, سوئٹزرلینڈ.