ملٹی فیکٹوریل سیروپروائلنگ ڈسیکٹس پہلے سے موجود انسانی کورونا وائرس کا حصہ SARS-CoV-2 مدافعتی نظام کے لیے ردعمل (حصہ 1)

مزید معلومات کے لیے plz رابطہ کریں۔david.wan@wecistanche.com

SARS-CoV کا تعین-2 ایکtibody جوابات میں دی خیال، سیاق کی پری-موجودہ قوت مدافعت کوگردش کرنے والا انسانی کوروناوائرس (ایچ سی وی) ہے تنقیدی کے لیے سمجھ حفاظتی قوت مدافعت. یہاںہم انجام دیں a ملٹی فیکٹوریل تجزیہ کی سارس-CoV-2 اور ایچ سی وی اینٹی باڈی جوابات میںپری وبائی بیماری (N = 825) اور سارس-CoV-2-متاثرہ عطیہ دہندگان (N = 389) استعمال کرتے ہوئے a اپنی مرضی کے مطابق-ڈیزائن کیا گیاملٹی پلیکس  ABCORA  پرکھ.  اینکورا,  کبمشترکہکے ساتھکمپیوٹیشنلماڈلنگ، ایک درست تعریف کو قابل بناتا ہے۔f  سارس-CoV-2  seroconversionاورپیشن گوئیکیغیر جانبداری سرگرمی, اور پتہ چلتا دلچسپ باہمی تعلقات کے ساتھ ایچ سی وی قوت مدافعت. خاص طور پر, SARS-CoV-2-منفی عطیہ دہندگان میں اعلی HCV اینٹی باڈی کی سطح تجویز کرتی ہے کہ پہلے سے موجود HCoV قوت مدافعت ہو سکتا ہےحفاظت خلاف سارس-CoV-2 حصول. میں وہ متاثرہ,اعلیایچ سی او وی سرگرمیہےمنسلککے ساتھبلند  سارس-CoV-2  جوابات,  کراس محرک کی نشاندہی کرتا ہے۔.  زیادہ تراہم بات,  ایچ سی وی  قوت مدافعتہو سکتا ہےکے اثرات بیماری شدت, کے طور پرمریضکے ساتھ اعلی ایچ سی او وی رد عمل ہیں کم امکان کو ضرورت ہے ہسپتال میں داخل. اجتماعی طور پر, ہمارے نتائجتجویز کریںکہ HCV استثنیٰ SARS-CoV-2-کی تیز رفتار نشوونما کو فروغ دے سکتا ہے۔قوت مدافعت, اس طرح انڈر سکورنگ دی اہمیت کی دریافت کراس-حفاظتی جوابات کے لیےجامع کوراونا وائرس روک تھام.

اینٹی باڈی ریسپو کی نگرانیnseکو  سارس-CoV-2  ہےتنقیدی کو ڈیfine تعلق رکھتا ہے کی ویکسین تحفظ، اختلافاتانفیکشن، اور بیماری کے لئے حساسیت میںse sہمیشہ. دی تصویر کی دی اینٹی باڈی زمین کی تزئین کو سارس-CoV-2 جو اب تک تیار ہوا ہے is پیچیدہ. دی اینٹی باڈی جواب کوسارس-CoV-2  ہےتیز اور مضبوط IgM، IgA، اور IgG کو متحرک کرتا ہے۔ جوابات1,2. میں جوابات کو پابند اور غیر جانبدار کرناcکے ساتھ آرام بیماری شدت اور دکھائیں میں حصہ انحصار پرآبادیاتی پیرامیٹرز اس طرح کے طور پر عمر اور صنف3–5. یہ باقی ہے، کیسے- کبھی، واضح نہیں کہ کون سے عوامل آزاد ڈرائیو ہیں۔ers کی اینٹی باڈیردعمل، شدید بیماری کی عکاسی cہمارا، یا ہیں پریشان کی طرف سےدوسرے عوامل بشمول انفیکشن لمبائی اور comorbidities.ڈھلنا  آئی جی جی پابنداور غیر جانبدار کرنااینٹی باڈی ٹائٹرزہو سکتا ہے ہوناخاص طور پر تلفظd میںافرادکے ساتھغیر علامتییا ہلکا انفیکشن6–9. آئی جی جی جوابات کو سپائیک (S) گلائکوپروٹین ہو سکتا ہےطویل عرصے تک جاری رکھیںr مقابلے کو nucleocapsid پروٹین (N)7,10,11 اور کر سکتے ہیں میںحصہ گزرنا affinity پختگی پوسٹ وائرس کلیئرنس5. کرنٹخدمتoمنطقی تجزیہ کرتا ہے بنیادی طور پر توجہ مرکوز پر پیمائش رد عمل N تک، اسپائک گلائکوپروٹین S1 سبونائٹ، اور ACE2 رسیپٹر بائنڈنگ ڈومین (آر بی ڈی) میں S12,5,12–16. اینٹی باڈیز ٹو آر بی ڈی اور رسیپٹر بائنڈنگ شکل wیہ دی آر بی ڈی تشکیل دی مرکزی گروپکی غیر جانبدار کرنا اینٹی باڈیز, پیروی کی کی طرف سے S1 ٹرامر مخصوصfic, سپائیکN-ٹرمینل ڈومین, اور سپائیک S2 غیر جانبدار کرنا اینٹی باڈیز16–22. S1 اور  آر بی ڈی  پابندباہمی تعلقکے ساتھغیر جانبدار کرناسرگرمیمیںدونوں قدرتی اور ویکسین کی حوصلہ افزائی مدافعتی ردعمل مجھے فراہم کرتا ہےns سے تخمینہ دی ممکنہ، استعداد کے لیے غیر جانبداری جہاں غیر جانبداریصلاحیت نہیں کر سکتے ہونا براہ راست تشخیص6,8,10. کمپلیکس پر غور کرنااینٹی باڈی ردعمل کے پیٹرن، POبہنیںکوقبضہدی حرکیات کی دی  سارس-متنوع امیونوگلوبلین پر CoV-2 ردعمل(Ig) کلاسز اور SARS-CoV-2 اینٹیجنز کی ضرورت ہے۔ seroconversion اور sero-reversio کا حساس پتہ لگاناn اورکوقائم کریںانفیکشن کے بعد حفاظتی، غیرجانبدارانہ سرگرمی کے لنکساور پوسٹ ویکسینیشن.

Cistanche کے بارے میں مزید جاننے کے لیے یہاں کلک کریں۔

انجیر. 1 سیروپروائلنگ سارس-CoV-2 جوابات. ایک تشخیص کے کی دی ملٹی پلیکس سارس-CoV-2 ABCORA 2.0 پر دی اشارہ کیا تربیت (N = 823) اور توثیق(N=635) گروہ (ضمنی جدول 3)۔ خالی مالا کنٹرول (MFI-FOE) کے لیے معمول کے مطابق MFI سگنلز کی تصویر کشی کی گئی ہے۔ گراy بکس اشارہ کریں اقدار اوپر انفرادی طور پر سیٹ ایم ایف آئی-FOE کاٹنا-بند کے لیے سارس-CoV-2 مخصوص جوابات کے لیے ہر ایک اینٹیجن (دیکھیں ضمنی ٹیبل 4). باکس پلاٹس نمائندگی دی درج ذیل:اوسط کے ساتھ دی درمیانی لائن, اوپری اور کم چوتھائی کے ساتھ دی ڈبہ حدود، اور 1.5x interquartile حدود کے ساتھ دی سرگوشیاں. b حرارت کا نقشہ نمائندگی ناپا ایم ایف آئی-FOE اقدار اور دی نتائج پیشن گوئی کے ساتھ ABCORA 2.0–2.3 کی تربیت اور توثیق گروہ پیمائش دکھایا گیا میں (a). منفی,مثبت, اور مثبت, جزوی حوالہ دیتا ہے کو درجہ بندی کے مطابق کو ABCORA 2.0 کے طور پر مخصوص میں ضمنی ٹیبل 5. c حساسیت اور خاصیت کی ABCORA 2پرکھ ورژن کی بنیاد پر پر دی مشترکہ تربیت اور توثیق گروہ ڈیٹا دکھایا گیا میں (a)۔ تناسب کیجھوٹے-منفی نمونے (حساسیت; سبز) اور تناسب کیغلط مثبت نمونے (خاصیت; نیلا) ہیں نمائندگی کی کی طرف سے دی کمی سے100 فیصد (بیرونی دائرہ) فی سیگمنٹ. d تشخیص کے کی ABCORA2.0 کے ساتھ دی قومی انسٹی ٹیوٹ کے لیے حیاتیاتی معیارات اور اختیار (این آئی بی ایس سی) مخالف سارس-CoV-2 تصدیق پینل (20/B770) پر مشتمل سارس-CoV-2مثبت (سرخ) اور منفی (نیلا) پینل سیرم نمونے. سرمئی بکس اشارہ کریں اقدار اوپر دی ABCORA 2.0 ایم ایف آئی-FOE کاٹنا-بند کے لیے سارس-CoV-2 مخصوص ردعمل کے لیے انفرادی اینٹیجن-آئی جی مجموعے. باکس پلاٹس نمائندگی دی درج ذیل: اوسط کے ساتھ دی درمیانی لائن, اوپری اور کم چوتھائی کے ساتھ دی باکس کی حد، اور 1.5x interquartile حدود کے ساتھ دی سرگوشیاں.

انفیکشنزکے ساتھگردشانسانکورونا وائرسز  (ایچ سی وی), الفاکورونا وائرس   (ایچ سی وی-229E,   ایچ سی وی-NL63)، اور بیٹا کور-کورونا وائرس (ایچ سی وی-HKU1, ایچ سی وی-او سی43), ہیں عام اورشراکت کافی حد تک کو دی موسمی سانس کی بیماری بوجھ میں انسانوں23,24. مجموعی طور پر معمولی ترتیب ہومولوجی کے باوجود کے درمیانen سارس-CoV-2 اور گردش HCoVs, کئی محفوظ علاقوں موجود اور اینٹی باڈی کراس-رد عمل ہو سکتا ہے واقع25–27. جبکہ برطرف میں دی تشخیصیغلط مثبت کے طور پر ترتیب دینا28، کراس رد عمل اینٹی باڈیز ہو سکتا ہے ریچھ حیاتیاتی مطابقت جیسا کہ تجویز کیا گیا ہے۔ سارس-CoV-2  S2  کراس-غیر جانبدار کرنا  اینٹی باڈیز29. بے یقینی باقی,تاہم، چاہے کراس رد عمل HCV اینٹی باڈی rاسپانساثر و رسوخدیارتقاءکی  سارس-CoV-2   مخصوصficقوت مدافعت. مثبت کے اثرات کی طرف سے فراہم کرنا جلد کم affinity میم-ory جوابات کو تعمیر پر اور بالغ کے طور پر ٹھیک ہے کے طور پر منفی میں- ences کی پیرویingدیاینٹیجنکگناہ   اصول30   کی طرف سےبڑھانا غیر حفاظتی کراس-ڈی نوو کے اخراجات پر رد عمل والے اینٹی باڈیز جوابات کر سکتے ہیں ہونا تصور کیا خاص طور پر نوٹ کریں، کراس رد عمل ایچ سی او ویT مددگار سیل جوابات تھے دکھایا گیا کو مثبت طور پر SARS-CoV-2 مخصوص استثنیٰ کو متاثر کرتا ہے۔31. اس کو دیکھتے ہوئے، کی تعریف پری-موجودہ قوت مدافعت واجب الادا کو پہلے انفیکشن کے ساتھ HCoVs مرضیبناہم میں طبی تشخیص، اور حکمت عملی کو ریکارڈandنقاب کشائیدیپیچیدہکے باہمی انحصارایچ سی وی  اور  سارس- CoV-2 جوابات sآئیڈیکی طرف سےطرفہیںضرورت ہےکوfillیہعلم خلا.

یہاں ہم ایک سیرولوجیکل پرکھ کی ترقی پر رپورٹ اجازت دیتا ہےملٹی فیکٹوریلseroprofiلنگکی سارس-CoV-2 اور HCVجوابات پر اعلی تشخیصی درستگی. بڑے کی سیروپروفلنگSAR کا گروہS-CoV-2 متاثرہ اور غیر متاثرہ افرادفراہم کیباہمی انحصار میں اہم بصیرتesکی ایچ سی وی  اورSاے آر ایس-CoV-2 اینٹی باڈی جوابات. دی نتائج نمایاں کریں a ممکنہ، استعداد HCV مخصوص کا حفاظتی کردارc جواباتمیں  سارس-CoV-2 حصولکے طور پرساتھ ہی SARS-CoV-2 ردعمل کی تشکیل میںپر انفیکشن.

Results

ملٹی فیکٹوریل   seroprofiلنگ   ڈیfines   سارس-CoV-2   مخصوصfic جوابات جامع SARS-C کی ضرورت کو تسلیم کرناoV-2 سیرولوجیکل SARS-CoV میں مرکزی سوالات کو واضح کرنے کے لیے پروفائلنگ-2قوت مدافعت اور اس کا باہمی انحصار کے ساتھ ایچ سی وی جوابات, ہمپیدا کیا a مالا پر مبنی ملٹی پلیکس امیونوسے مخصوص پیمائش کے لیے آئی جی جی, آئی جی اے اور آئی جی ایم جوابات SARS-CoV-2 RBD، S1، S2 اور N کو (ضمنی انجیر. 1). دی پرکھ ریکارڈز کل 12 SARS-CoV- 2 مخصوص اینٹی باڈی پیرامیٹرز (3 Ig کلاسوں میں 4 اینٹیجنز) کے ساتھاعلی تشخیصی درستگی (طریقے دیکھیں، ضمنی انجیر۔ 1–3 اور ضمنی جدولیں 1، 2) اور مزید شامل ہیں۔e S1 پروٹین کی ایچ سی وی-HKU1 کو سکرین کراس-رد عمل اینٹی باڈیزساتھ ساتھ سارس-CoV-2 جوابات۔ ٹیسٹ کے ڈیزائن کے مطابق نگرانی کرنے کے لئےtibodies کو دو کورونا وائرسز, ہم قرار دیا دی پرکھ اینٹی بوD y کورونا وائرس پرکھ (ABCORA) 2.0.

ABCORA میں پیمائش کا اظہار اس طرح کیا جاتا ہے۔اوسط لالچ- سائنس کی شدت (MFI) نے درست کیاr پس منظر پابند(فول اوورخالی موتیوں کی مالا,  FOE).  کوممتاز  سارس-CoV-2-مخصوص کراس ریک سےٹائیو اینٹی باڈیز, ہم ڈیfined ایم ایف آئی-FOE دہلیز 12 SARS-CoV-2 antigens اور Ig کلاس کے امتزاج میں سے ہر ایک کے لیےsکی بنیاد پر پر پلازما اینٹی باڈی رد عمل میں تربیت گروہ کیپری وبائی بیماریصحت مندعطیہ دہندگان  (تربیت  I,  N=573)، عطیہ دہندگان کے ساتھحالیہ ایچ سی وی انفیکشن  (تربیت II, N = 75) اور عطیہ دہندگان کے ساتھconfirmed SARS-CoV-2 انفیکشن (ٹریننگ III، N=175) (تصویر۔1a, ضمنی جدول 3)۔ مثبت کال کے معیار کی وضاحت کی گئی تھی۔معلوم کرنا کہمیںپرکم از کمدوکیدی12 اینٹیجنزاور  آئی جیcombinations دی دہلیز ہے پہنچ گئے (ضمنی ٹیبل 4).دیfinalدہلیزاورمثبتکالمعیاراجازت دیکے لیےتفرق کی جزوی (صرف آئی جی ایم اور آئی جی اے جوابات) کو مکملseroconversion (بشمول آئی جی جی جوابات). میں اضافہ, دی معیاراشارہ کرنانمونےکے ساتھw k رد عملاور/یاغیر متعینرد عمل (ضمنی Table 5).

انجیر. 2 مقدار کا تعین کی سارس-CoV-2 مخصوص اینٹی باڈی جوابات. a–c تقسیم کی (a) 50 فیصدمؤثر ارتکاز (ای سی50; اظہار کیا کے طور پر باہمی پلازما کم کرنا) اور (b) رقبہ کے تحت دی وکر اقدار (اے یو سی; اظہار کیا کے طور پر ایم ایف آئی) کی titrated پلازما سے سارس-CoV-2 مثبت بالغوں (N = 72) ماپاABCORA 2 کے ساتھ۔{1}}۔ c ٹائٹریٹڈ SAآر ایس-CoV-2 آر بی ڈی اور S1 جوابات تھے مقدار کا تعین استعمال کرتے ہوئے دیآر بی ڈی مخصوص مونوکلونل اینٹی باڈی سی آر3022 (پیدا کیا کے طور پر آئی جی جی,آئی جی اے، اور آئی جی ایم; اظہار کیا کے طور پر این جی/ملی لیٹر) کے طور پرایکبیرونی معیاری. دیکھیں ضمنی انجیر. 7 کے لیے اضافی مقدار کا تعین کے ساتھ دی ڈبلیو ایچ او بین اقوامی معیاری مخالف- سارس-CoV-2 امیونوگلوبلین. d سپیئر مین ارتباط ABCORA 2۔{1}} پر مبنی کوانٹیفیکیشن ریڈ آؤٹس (EC50, AUC, RBD کے درمیان میٹرکس تشخیصی معاہدہاب معیاری), دی بنیادی ایم ایف آئی-FOE ماپا پر 1/100 پلازما کم کرنا (لاگ), اشارہ کیا خلاصہلاگ MFI-FOE اقدار (1/100 dilution)، اور Roche Elecsys Anti-سارس-CoV-2 (S) پرکھ نتائج (U/ملی لیٹر). غیر اہم ارتباطات ہیں بائیں خالی. سطحیں کی اہمیت ہیں اندازہ لگایا کی طرف سے a دو-رخا پرکھ پر asymptotic t قربت کی سپیئر مین's درجہ ارتباط اور درست کیا کی طرف سے دی بونفیرونی طریقہ کے لیے متعدد ٹیسٹنگ (p< 0.05/780)۔رنگ شیڈنگ کا مطلب ہےدیارتباط عددی سر.

Pre-عالمی وباء مریض کے ساتھ دستاویزی, حالیہ ایچ سی ویانفیکشن (تربیت II, N = 75; او سی43 (N = 27), HKU1 (N = 17)، NL63(N = 22),  229E  (N = 9))مختلف افراد پر مشتمل ہے۔بنیادی   شدید   بیماریاں   بشمول  مدافعتی سمجھوتہمریض کہ گزرا تشخیصی اسکریننگ کے لیے ایچ سی وی. ایچ سی وی کی خصوصیتfic سرگرمی تھا مجموعی طور پر کم میں یہ سنڈرومک گروپ لیکنظاہر ہوا، جیسا کہ توقع تھی۔d,  افزودہ  ایچ سی او ویرد عملخلافدی میںمتاثر کرنا ایچ سی وی (ضمنی انجیر. 4). اہم بات, ہم مشاہدہ کیا نہیں SARS-CoV-2 اینٹیجنز کے ساتھ کراس ری ایکٹیویٹی کا اشارہ اثر انداز دی ABCORA ریڈ آؤٹ (انجیر. 1a, b). سب کے ڈیٹا پر غور کرنا تربیتی گروہ (I–III)، ABCORA 2.0 نمائش اعلی حساسیتاور مخصوصfiشہر, پہنچنا 94.29 فیصد حساسیت اور 99.07 فیصد مخصوصیت (انجیر. 1c, ضمنی جدول 3)۔

کو کراس ری ایکٹیویٹیز اور ایک دوسرے پر انحصار کے تجزیہ کو فعال کریں SARS-CoV-2 اور HCV اینٹی باڈی کے درمیان شہرes, ہم محفوظ شدہHCV-H کے S1 یونٹ میں رد عملکے یو1 میں اضافہ کو دی سارس- CoV-2اینٹیجنز (انجیر. 1a). واجب الادا کو دی اعلی پھیلاؤ کی ایچ سی وی اینٹیبوdies اور دی آنے والا کمی کی سچ-منفی کنٹرول کرتا ہے, ہم سیٹنہیںدہلیزکوHKU1 ری ایکٹیویٹی کو مثبت/منفی کے طور پر درجہ دیں۔مجموعی طور پر، SARS-CoV-2 کراس ری ایکٹیویٹی پری پی اے میں کم تھی۔وبائی مرضنمونےکے باوجودقابل ذکر  HKU1  سرگرمی  (انجیر.  1a)۔ ارتباط تجزیہ نازل کیا معمولی باہمی انحصار SARS-CoV-2 اورHKU1 پلازما اینٹی باڈی رد عمل میں سارس-CoV-2 مثبت اور پری-عالمی وباء عطیہ دہندگان. اس میں بنیادی طور پر IgM ردعمل شامل تھا۔حالیہ ایچ سی وی انفیکشن والے افراد کے ساتھدیسب سے زیادہHKU1 اور SARS-CoV کے لیے IgM میں ارتباط-2acتنگی (ضمنی انجیر. 5). یہ ڈیٹا انڈر لائن کہ a کم کراس رد عمل کی سرگرمی کی سطح موجود ہے جس کا احترام کرنے کی ضرورت ہے۔d میںپرکھ ڈیزائن, تجزیہ، اور توثیق.

ویریfiکیشن کی ABCORA 2.0کے الگ الگ توثیقی گروہوں پرپری-عالمی وباء صحت مند بالغوں (N = 252) وبائی امراض سے پہلے کے بچے(N=169)، اور دستاویزی SARS والے افراد-CoV-2 انفیکشن (N = 214) (انجیر. 1a, بی، ضمنی جدول 3) تصدیق شدہ ویںe درست کی دی منتخب کیا پرکھ معیار. یکجا کرنا تربیت اورSARS-CoV-2 positive افراد (N = 389)اورمنفیکنٹرول کرتا ہے (N {{0}})، ABCORA 2.0 نے حاصل کیا۔حساسیت کی 94.60 فیصد اور 99. 16 فیصد کی ایک خصوصیت (تصویر 1)1c).

قابل غور بات یہ ہے کہ ch کا تجزیہ کرتے وقتبچوں اور بالغوں میں دی توثیقگروہ الگ سے, ہم کے درمیان قدرے کم خاصیت کا مشاہدہ کیا۔ بچے(98.82 فیصد)موازنہکوبالغوں(99.60 فیصد)اٹھانادیامکان کہ کراس-رد عمل سرگرمی میں بچے ہو سکتا ہے ہونا مزیدبالغوں کے مقابلے میں عام ہے. درحقیقت، پری وبائی امراض نے دکھایاa IgM HKU1 اور SARS-CoV-2 کے درمیان اعلی ارتباط (ضمنیتصویر 5c)، اس تشریح کو اجاگر کرناپر کی آئی جی ایم سارس-CoV-2 سرگرمی کر سکتے ہیںہونا پیچیدہ. کمپیوٹیشنل تجزیہ کرتا ہے زیادہ سے زیادہ مخصوصfiشہر اور حساسیت کی

ایس اےآر ایس-CoV-2 seroprofiلنگ. کو مزید اضافہدیمخصوصfiشہر کی دی ریڈ آؤٹ, ہم اگلے دریافت کیا دو کمپیوٹیشنل تجزیہ ایکسٹینشنز، ایک لاجسٹک ریگریشن ماڈل (ABCORA 2. 1) اور ایک بے ترتیب ایفoآرامماڈل (ABCORA 2.2). دونوں تجزیہ حکمت عملی تھے قائمپر دی ایک جیسی تربیت ڈیٹاسیٹ  (تربیت I–III) استعمال کیا جاتا ہے کے لیے سیٹ اپکی  ABCORA  2.0.  اس کے بجائےکیحاصل کرنا  12  انفرادیدہلیز  (ایکفیاینٹیجن اور آئی جی کلاس)، کمپیوٹیشنل ماڈل مکمل طور پر نمونے کے پوزی ہونے کے امکان کا اندازہ لگاتے ہیں۔tiveac فراہم کر کےoمتضاد نتیجہ اس پار تمام 12 پیمائش اور بھاگ گیاkingسیرا مثبتیامنفی  (1,  0  کلاسیfiکیشن).  کے لیے دیلاجسٹک ریگریسآئن  ABCORA  2. 1,  ہمگروپ  سارس-CoV-2 پابند سرگرمیاں جو اعلی ارتباط کو ظاہر کرتی ہیں (ضمیمہاندراج تصویر. 6a) اور شامل دی مطلب قدر کی ان کا ایم ایف آئی-FOEs ماڈل میں. دی بے ترتیب جنگل ماڈل ABCORA 2.2 شامل تمام 12 SARS-CoV-2 جوابات کی پیمائش کی گئی اور اس کے نتائج کو جمع کیا۔ 1000 کلاسیfiکیشن درخت. پر دی مشترکہ تربیت اور توثیقگروہکی  سارس-CoV-2  مثبتافراد  (N = 389)  اور منفی کنٹرول کرتا ہے  (N = 825), ABCORA 2.2 حاصل کیا a مارنے والاحساسیتکی97.43 فیصداور a مخصوصfiشہر کی99.91 فیصدبہتر کارکردگیدونوں ABCORA 2.0 اور 2. 1. قابل غور بات، ABCORA کی طرف سے مثبت کالنگ 2.2 تھا غلبہ بذریعہ IgG جوابات (ضمیمہ تصویر 6b)۔

ہم اگلے دریافت کیا چاہےدیشامل کرنا کی HKU1 میں رد عمل دی بے ترتیب جنگل ماڈل ہو سکتا ہے مزید بہتر کریں دی کالنگ کی خصوصیتfiشہر اور حساسیت. بے شک, a ماڈل جس میں HKU1 شامل تھا۔S1  ایک کے طور پراضافیمتغیر  (ABCORA  2.3) حساسیت میں اضافہ سے ABCORA میں 97.43 فیصد 2.2 سے 98.20 فیصد (تصویر 2)1c، سپلیمنٹری ٹیبل 3) بغیر کسی کمی کےtion کی دی مخصوصfiشہر. A حساسیتکراس توثیق تجزیہ کے ساتھ بے ترتیب تربیت اور توثیق سیٹconfirmedدیکارکردگیکی ABCORA  2.3 (ضمنی جدول 6)۔ اوویاین جی کو اس کا مشترکہ اعلی حساسیت اور مخصوصfiشہر, لہذا، ہم نے ABCORA 2.3 کو تجزیہ کی حکمت عملی کے طور پر منتخب کیا۔ درجہ بندی عالمی SARS-CoV-2 seroconversion۔

ہم اگلے ویریfiایڈ دیABCORA 2 کی درستگی۔{1}} اور 2.3 انچمثبت اور منفی SARS-C کی تعریفoV-2  مدافعتیحیثیت کا استعمالدی  قومی  انسٹی ٹیوٹکے لیے  حیاتیاتی  معیاراتاور کنٹرول  (این آئی بی ایس سی)  مخالف  سارس-CoV-2  ویریfiکیشن  پینل  (20/ B770)32. یہ تصدیقعمل پینل کے لیے سیرولوجی assays شامل 23 مثبت اور 14 منفی سیرم سیمplesاوراجازت دیتا ہےبراہ راستموازنہ ڈبلیوith دوسرے پرکھ نظام32. دونوں ABCORA ورژندکھایا100 فیصدحساسیت اور100 فیصدمخصوصfiشہر پر تصدیق پلازماپینلاور تجارتی پرکھ سے سازگار طور پر موازنہ کیا۔ نظام  (انجیر.1d، ضمنی جدول 7)۔ کراس ریفرنس کے لیے یہبیرونیویریfiکیشننتائج، ہم اگلے مقابلے میں seحساسیت کی دی ABCORA ٹیسٹ اور تین تجارتی سیرولوجیپرکھ نظام پر a ذیلی سیٹ کی دی سارس-CoV-2 مثبت تربیتcohort (cohort III، N=171)۔ کو نشانہ بنانے کے AssaysN  پروٹین(Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 (Roche Diagnostics GmbH))، the آر بی ڈی علاقہ کی دی S پروٹین (الیکسس®اینٹی SARS-CoV-2 ایس پرکھ (روشے تشخیص GmbH)), اور دی S1 ذیلی یونٹ (EUROIMMUNمخالف-سارس-CoV-2 ELISA (IgG)) شامل تھے۔ نتائجcپرfirmedدیتجزیہپردیبین اقوامی  این آئی بی ایس سی  20/B770 پلازما پینل,ABCORA 2 کے ساتھ۔{1}} اور ABCORA 2.3 دکھا رہا ہے۔ آزمائشی اسیسز میں سب سے زیادہ حساسیت (Supplementary Tقابل 8).

اس طرح ہم یہ نتیجہ اخذ کرتے ہیں کہ ABCORA   2.0   seroprofiلنگمجموعہ میں کے ساتھ  ABCORA  2.3  ڈیfinesمثبتیتکے ساتھدیسب سے زیادہ مخصوصfiشہر اور حساسیت. انفرادی اینٹیجن ردعمل ABCORA 2 کے ذریعے تشخیص۔{1}} se کے مرحلے کی وضاحت کرتا ہے۔roconversionحالت کی بنیاد پر پر انفرادی IgM، IgA، اور IgG کٹ آف ویلیوز اوراس طرح تکمیل اور زیادہ سے زیادہ کرتا ہے وہ معلومات جو ہو سکتی ہیں۔ ABCOR کے ذریعے حاصل کیا گیا۔A 2 seroprofiلنگ.

انجیر. 3 ایسوسی ایشن کی پابند اور غیر جانبداری سرگرمی میں جلد اور دیر انفیکشن. a50 فیصدنیوٹرلائزیشن ٹائٹرز (این ٹی50) ٹائٹرز خلاف ووہان-ہو-1سیوڈوٹائپ میں مریض کے ساتھ جانا جاتا ہے مثبت سارس-CoV-2 RT-پی سی آر تاریخ (N = 369). مریض تھے سطحی کے مطابق کو وقت جب سےدیپہلا تشخیص تحقیقات کے لئے جلد (کم مقابلے 30 دنRT-PCR کے بعد, لیوینڈر) اور دیر (مزید مقابلے 30 دنRT-PCR کے بعد, فیروزی) غیر جانبداری جوابات. فرقکے درمیان یہ دو گروپس تھا اندازہ لگایا کے ساتھ a لکیری ملا ہوا ماڈل کے ساتھ وقت جب سے RT-پی سی آر (بائنری متغیر جلد/دیر) کے طور پر a طے شدہ اثر اور انفرادی بے ترتیب کے طور پر اثر اور استعمال کرتے ہوئے سیٹرتھویٹ قربت کے لیے a دو-رخا t-پرکھ پر دی پیرامیٹر منسلک کے ساتھ وقت جب سے RT-پی سی آر. باکس پلاٹس نمائندگی مندرجہ ذیل: اوسط کے ساتھ دی درمیانی لائن, اوپری اور کم چوتھائی کے ساتھ دی ڈبہ حدود، اور 1.5x interquartile حدود کے ساتھ دی سرگوشیاں. b لکیری رجعت تجزیہ کو وضاحت کریںدیایسوسی ایشن کے درمیان غیر جانبداری (باہمی این ٹی50) اور اینٹی باڈی پابند (ایم ایف آئی-FOE). سیاہ لائنیں اشارہ کریں لکیری رجعت پیشن گوئیاں اور سرمئی سایہ دار علاقوں مطابقت کو دی95 فیصداعتماد وقفے. نتائج بیان کرنا جلد (لیوینڈر), دیر (فیروزی), اور مکمل گروہ (سیاہ). n.s. غیر اہم کی طرف اشارہ کرتا ہے۔ نتائج. سطحیں کی اہمیت ہیں اندازہ لگایا کی طرف سے a دو-رخا پرکھ پر دی غیر علامتی t قربت کی سپیئر مین's درجہ ارتباط, اور درست کیا کی طرف سے دی بونفیرونی طریقہ کے لیے متعدد ٹیسٹنگ (p< 0.05/1200،دیکھیں ضمنی انجیر. 8b اور 9).

پیشین گوئی کرنا  سارس-CoV-2  غیر جانبداری  کی بنیاد پر  پر  اینکورا

seroprofiلنگ.  تعین کرنا غیر جانبداری سرگرمی ہے تنقیدی کوگیج تحفظٹائیو قوت مدافعت. جبکہ غیر جانبداری کر سکتے ہیں ہونا براہ راستمستند وائرس یا pseudoviru کی ایک رینج کے ساتھ ماپا جاتا ہے۔s سارس-CoV-2  غیر جانبداری کے ٹیسٹ5,22,33، براہ راست بائنڈنگ کا اطلاق کرنا یانیوٹرالیزا کے لیے سروگیٹس کے طور پر مقابلے کے ٹیسٹtion سرگرمی باقی ہیلو کاgh دلچسپی کے لیے تشخیصی مقاصد کہاں سیل-کی بنیاد پر assaysہیں مزید diffiفرقہ کو نافذ کرنا33,34. میں خاص, S1اور آر بی ڈیبندیng اور ACE2 مقابلہ ہے رہا دکھایا گیا کو باہمی تعلق ٹھیک ہے کے ساتھ غیر جانبداری سرگرمی5,8,10,19,33–37. نیوٹرلائزیشن کو دریافت کرنے کے لیے ABCORA 2 پر مبنی پیشن گوئی کرنے والے۔{1}}، ہم probed میں a fiپہلا قدم دیٹوپیaشہر کی ABCORA کو اخذ کردہ مقداری S1 اور آر بی ڈی ریڈ آؤٹ میں a ذیلی سیٹ SARS-CoV-2 مثبت مریضوں (N=72)۔ اینکورا2۔{1}} پیمائشعناصر کی سلسلہ وار پتلا پلازما تھے منعقد کیا کو اخذ کردہ  50فیصدمؤثر ارتکاز (EC50، جس کا اظہار بطور تلاوتپروکول پلازما کم کرنا) اور رقبہ کے تحت دی وکر اقدار (اے یو سیMFI کے طور پر ظاہر کیا گیا) تمام 12 SARS-CoV-2 پیرامیٹرز کے لیے (تصویر2a, b). In اضافہ, ہم مقدارfiایڈ سارس-CoV-2 آر بی ڈی اور S1 جواباتذریعے دی آر بی ڈی مخصوصfic ایم اے بی سی آر302238  (انجیر. 2c) اور دی ڈبلیو ایچ اوبین الاقوامی معیاری اینٹی SARS-CoV-2 امیونوگلوبولیn این آئی بی ایس سی 20/13632 (ضمنی اعداد و شمار 7b، ضمنی اعداد و شمار 1)۔ آگےہے،ہممقدارfiایڈدیمتعلقہاینٹی باڈیموادکیa مثبتاختیار   سارس-CoV-2   ڈونرپولشاملمیںتمام ABCORA پیمائش اور اظہار کیا دی کے اینٹی باڈی مواد انفرادی پلازماmplesکے بارے میں یہ (انجیر. 2c، سپلیمنٹری انجیر. 7). ہم پھر تحقیقات ABCORA مقداری میں سے کون ساریڈ آؤٹ متعلقہ بہترین کے ساتھ ہر ایک دوسرے, دی بنیادی ریڈ آؤٹ کیABCORA 2۔{1}} (MFI-FOE at پلازما dilution 1/100)، اور ویںe مقداری روشے الیکسس S پرکھ (U/ml) (تصویر2c، سپلیمنٹری تصویر 7)۔ additi میںپر کو دی انفرادی اینٹیجن پیرامیٹرز, ہم بھی مجموعی دوبارہ سمجھا جاتا ہے۔اسپانس اقدار. یہ تھے کل سپائیک رد عمل (رقم کی آر بی ڈی,تمام Ig کلاسز میں S1، اور S2)، Ig کلاس اسپائک رد عمل (ایک آاسوٹائپ کے لیے S1، RBD، اور S2 کا مجموعہ)، اور اینٹیجnمخصوصfic رد عمل  (رقم کی تمام آئی جی کلاسز کے لیےایکاینٹیجن). ہمoمشاہدہ کیا a حقیقی طور پر اچھی ارتباط اس پار دی متنوع سپائیک ٹیسٹ شدہ پیرامیٹرز (تصویر2d)۔ قابل ذکر استثناء کلاسک تھا۔ال ای سی50 اقدار, کونسا دکھایا نہیں کو کمزور ارتباطاس پار تمامپرمetersبشمولدیتجارتیپرکھ.  دلچسپ بات ہے۔,  اے یو سیاقدار, کونسا میں برعکس کو ای سی50 ہیں a جامع پیمائش ارتکاز کی اور سگنل طاقت, کارکردگی کا مظاہرہ کیا ٹھیک ہے. کی نوٹ کریں، ہممشاہدہ کیا انتہائی متغیر  سارس-CoV-2اینٹی باڈی خوراک کا جوابمنحنی خطوط, پہنچنا میں ہمارے گروہ انفرادی سطح مرتفع ختم a 4-لاگرینج (ضمنی انجیر. 7)۔ ان سطح مرتفع کا احترام کیا جاتا ہے۔ AUC ریڈ آؤٹ، اور بنیادی MF کے ذریعہ بھی ریکارڈ کیا جاتا ہے۔I-FOE ABCORA ریڈ آؤٹ پر  1/100 پلازما کم کرنا, لیکن ہیں نہیں con-

EC50 کے تعین میں طرفداری کی۔ درحقیقت بنیادی MFI-FOEدکھایا a بھر میں مقداری پڑھنے کے ساتھ اعلی ارتباط ٹیسٹ شدہ متغیرes بشمول دی مقداری تجارتی روشے الیکسس ایس ٹیسٹ۔

ان نتائج کی بنیاد پر، ہم نتیجہ اخذ کرتے ہیں۔d کہدی  ایم ایف آئی-FOEریڈ آؤٹ صرف پر دی  1/100 پلازما کم کرنا فراہم کرتا ہے a انتہائیreliقابل تخمینہ کے لیے دی S1 اور آر بی ڈی اینٹی باڈی مواد میں پلازما جسے ضرورت کے بغیر مقدار کے تعین کے لیے بطور پراکسی استعمال کیا جا سکتا ہے۔ ٹائٹریٹ نمونہes. ہم، لہذا، ملازم دی بنیادی ایم ایف آئی-FOE میں دی اگلاt قدم کو ڈیfine غیر جانبداری پیشن گوئی کرنے والے.

ووہان-ہو- 1 میں غیر جانبداری کی سرگرمیn   سارس-CoV-2 مثبت افراد (N=467) ایک اسٹیبلی کا استعمال کرتے ہوئےشیڈ سارس-CoV-

2 سیوڈو وائرس غیر جانبداری پرکھ5,22,33 کی ایک وسیع رینج کا انکشاف کیا۔ 50 فیصدغیر جانبدار کرنا ٹائٹرز  (این ٹی50)  (پوسٹ مثبت RT-پی سی آر انجیر. 3a (N=369)، علامات کے بعد کے آغاز، ضمنیy  انجیر.  8a (N = 333)), میں لائن کے ساتھ پچھلے findings5,8. جلدی میں انفیکشن(کے اندر 30 دن کی مثبت RT-پی سی آر) غیر جانبداری ٹائٹرز تھےنشانیfiآسانی سے اعلی (p< 0.001) اور بائنڈنگ کے ساتھ بہتر تعلق رکھتا ہے۔ پیرامیٹرز.جیسا کہ توقع کی گئی ہے، اسپائک اینٹیجنز پر آئی جی جی کے ردعمل ظاہر ہوئے۔دیسب سے زیادہارتباطکے ساتھغیر جانبداریسرگرمی  (انجیر.  3b, ضمنی انجیر. 8,9)۔ ہم نے اگلی بنیاد پر مریضوں کو گروپ کیا۔آبادیمیںاعلی  (این ٹی50 > 250،N =332) اور نہیں یا کمنیوٹرلائزرز (این ٹی50< 250، N=135)39 (انجیر.4a) اور موازنہ کریں۔پیشن گوئی صلاحیت کی چھ مختلف کلاسیfiکیشن ماڈلز کو تفویضافراد کی بنیاد پر پر ان کا ABCORA 2۔{1}} ان کے لیے بائنڈنگ پیٹرن گرویو پی ایس. غیر متغیر لاجسٹک رجعت  (یو ایل آر) ماڈلز صرف شامل ایک متغیر: یا تو دی مطلب کی ایم ایف آئی-FOE S1 رد عمل(ULR-S1) یا MFI-FOE RBD reactivities (ULR- آر بی ڈی)۔ ایک ملٹی ویری ایبل لاجسٹک ریگریشن (MLR) میں S1 دونوں شامل ہیں۔ and آر بی ڈی مطلب رد عمل. دی اضافی ماڈلز شامل تمام 12 ABCORA اور comp میں ماپا گیا اینٹیجن ری ایکٹیویٹیriseda رینڈوm جنگلنقطہ نظراوردو  ایم ایل آر  حکمت عملیکی بنیاد پرپراصول جزو تجزیہ (پی سی اے, 2 اور 4 fiپہلا محور). ماڈلزتھےموازنہکی بنیاد پراے یو سی اور بی آئی سی پر (بایشینمعلومات  معیار40) کراس توثیق کے ذریعے (تصویر4b، c)۔ تمامماڈلز فیتشکیل دیا اسی طرح, کے ساتھ دی غیر متغیر ماڈل کی بنیاد پر پر دی مطلب کی S1 ری ایکٹیویٹیز (ULR-S1) بہترین BIC ویلیو حاصل کرتی ہے۔ وصول کنندہآپریٹنگوکر  (آر او سی) ULR-S1 پر مبنی تجزیہدکھایاa  اچھیصلاحیتغیر جانبداری کی حیثیت کی پیشن گوئی میںحاصل کرنے والا اے یو سی 0.90 (N=467، تصویر۔4d)۔ مختلف کٹ آفز کی تلاش ب کوتوازن حساسیت اور مخصوصfiشہر رکھنا دونوں اوپر80 فیصد،ہممنتخب کیاکوہائی نیوٹرلائزر گروپ کو نمونے تفویض کریں اگر یہ ہے۔ پیش گوئی کا امکان 70 فیصد سے زیادہ تھا۔ یہ ایک سے مساوی ہے۔n83 فیصدمخصوصfiشہرمیںصحیح طریقے سےتفویض کرناغیر نیوٹرلائزر اور 80 فیصدنیوٹرلائزرز کو تفویض کرنے میں حساسیت (تصویر 1)۔4ڈی، ای)۔ بڑھانے کے لیےe دیافادیت کی دی یو ایل آر-طبی تشخیص کے لیے S1 پیشن گوئی ماڈل، ہم ایک ترمیم شدہ نیوٹرلائزیشن پیشن گوئی ماڈل ULR-S1- وضع کیاSOC پر مبنی پر دی SOC اقدار اطلاع دی کے لیے ABCORA 2.0. پر70 فیصدپیشن گوئی امکان, یو ایل آر-S1-ایس او سی غیر جانبداری سے پہلے فراہم کرتا ہے۔diction at similarحساسیت(81 فیصد)اورمخصوصfiشہر(81 فیصد)کی طرف سےجانچنا کہ آیا جامع S1 SOC قدر (S1 SOC val کا مجموعہuکے لئے es  آئی جی جی,  آئی جی اے،اور  آئی جی ایم)  ہےنیچےیااوپر  9.7   (انجیر.  4f). اسی کے مطابق، 17.3 سے اوپر کی S1 SOC قدر t کے مساوی ہے۔oایک حساسیتکی67 فیصداور مخصوصfiشہر94 فیصد کاکی نوٹ, دی باہمی تعلقاتکے درمیان غیر جانبداری اور S1 سطح یکساں طور پر ظاہر تھے جبہمتحقیقاتa  کمکاٹنا-بندکیغیر جانبداری   (این ٹی50 <100) (ضمنی شکل 10، ضمنی جدول 9)۔ لہذا ہم، نتیجہ اخذ کرنا کہ دی بنیادی SOC ریڈ آؤٹ میں ABCORA 2۔{1}} ڈیلیور کر سکتا ہے۔ a قابل اعتماد پیشن گوئی کی اعلی غیر جانبداری سرگرمی.

انجیر. 4 پیشین گوئی کرنا غیر جانبداری صلاحیت کے طور پر a فنکشن کی پابند سرگرمی. a سارس-CoV-2 مثبت عطیہ دہندگان (N = 467) تھے سطحی میں اعلی نیوٹرلائزرز(این ٹی50 > 250, N = 332; نیلا) اور نہیں/کم نیوٹرلائزرز (این ٹی50 <250،N = 135; سرمئی), کی بنیاد پر پر ان کا غیر جانبداری سرگرمی خلاف ووہان-ہو-1. b, c موازنہ کی دی پیشن گوئی صلاحیت کی چھ مختلف درجہ بندی ماڈلز استعمال کرتے ہوئے 100 کراس-توثیق سیٹ (تقسیم کے طور پر80 فیصدکے لیے تربیت اور20 فیصدتوثیق کے لیے). b موازنہ کی ماڈلز کی طرف سےدیرقبہ کے تحت دی وکر (اے یو سی). ہر ایک ڈاٹ مطابقت رکھتا ہے کو ایک کراس-توثیق سیٹ. c Bayesian معلومات معیار(بی آئی سی) کی دی لاجسٹک ریگریشن پر مبنی پانچ ماڈل۔ مختلف ماڈلز غیر متغیر لاجسٹک ریگریشنز (ULR) ہیں۔ ULR-RBD: MFI-FOE RBD کا مطلب۔ULR-S1: MFI-FOE S1 کا مطلب۔ ملٹی ویری ایبل لاجسٹک ریگریشن (MLR)۔ MLR-S1، RBD: S1 ری ایکٹیویٹی کا مطلب اور RBD ری ایکٹیویٹی کا مطلب۔ MLR-PCA2 اورMایل آر-پی سی اے4: ایم ایل آر کی 2 اور 4 پہلا محور کی پی سی اے تجزیہ, بالترتیب. پی سی اے تھا کی بنیاد پر پر تمام 12 سارس-CoV-2 اینٹی باڈی رد عمل ماپا کی طرف سے ABCORA 2.0.  بے ترتیب جنگل (RF) شامل ہیں۔ڈنگ تمام اینٹی باڈی رد عمل ماپا کی طرف سے ABCORA 2.0. باکس پلاٹس نمائندگی دی درج ذیل: اوسط کے ساتھ دی درمیانی لائن, اوپری اورکم چوتھائی کے ساتھ دی ڈبہ حدود, سرگوشیوں کے ساتھ 1.5x انٹرکوارٹائل رینجز، اور پوائنٹس کے ساتھ آؤٹ لیرز۔ d ULR-S1 نے مکمل ڈیٹا سیٹ کی بنیاد پر ROC وکر کا تخمینہ لگایا (N = 467). e ناپا این ٹی50 قدر بمقابلہ امکان کی این ٹی50 > 250کے طور پر پیشن گوئی کی طرف سے یو ایل آر-S1 میں پانچتصادفی طور پر منتخب کردہ توثیق سیٹ (ہر ایک علامت سے مطابقت رکھتا ہے۔ کو a توثیق سیٹ)۔ جامنی رنگ کا علامتیں اشارہ کریں a اعلی مقابلے 0.70 امکان کی دی متعلقہ نمونہ کو ہونا غیر جانبدار کرنا پر این ٹی50 > 250اور ہیں لہذا اشارہ کیا کے طور پر اعلی نیوٹرلائزرز. سرمئی اشارہ کرتا ہے نمونے کے ساتھ پیشن گوئی غیر جانبداری این ٹی50 <250،لہذا درجہ بندی کے طور پر نہیں/کم نیوٹرلائزر. f نیوٹرلائزیشن پیشن گوئی کی بنیاد پر پر a ترمیم شدہ یو ایل آر-S1 ماڈل استعمال کرنا دی تشخیصی ریڈ آؤٹ SOC اس کے بجائے کی ایم ایف آئی-FOE اقدار کے طور پر ان پٹ.ناپا این ٹی50 قدر بمقابلہدیرقم کی S1 SOC اقدار (IgG، IgA، IgM) کو دکھایا گیا ہے۔ ڈیشڈ لائنیں NT50=250 افقی طور پر اور S1 SOCs کے مجموعہ سے مطابقت رکھتی ہیں = 9.7 عمودی طور پر. دی رقمکیS1 SOCs = 9.7 مطابقت رکھتا ہے کو دی دہلیز دکھایا گیا کے لیے یو ایل آر-S1 میں (d, e). دی سرمئی سایہ دار رقبہ مطابقت رکھتا ہے کو حقیقی مثبت (افراد کے ساتھ این ٹی50 > 250پیشن گوئی کے طور پر اعلی نیوٹرلائزرز).