SLC41A1 میں الزائمر کی بیماری سے وابستہ SNP Rs708727 پارکنسنز کی بیماری کے خطرے کو بڑھا سکتا ہے: توسیع شدہ سلوواک اسٹڈی پارٹ 1 سے رپورٹ

خلاصہ:

SLC41A1 (A1) SNPs rs11240569 اور rs823156 پارکنسنز کی بیماری (PD) کے بدلے ہوئے خطرے سے منسلک ہیں، بنیادی طور پر ایشیائی آبادی میں، اور rs708727 کو الزائمر کی بیماری (AD) سے جوڑا گیا ہے۔ اس مطالعے میں، ہم نے سلواک آبادی میں PD کے ساتھ مذکورہ بالا تین SNPs اور rs9438393، rs56152218، اور rs61822602 (تینوں A1 پروموٹر کے علاقے میں پڑے ہوئے) کی ممکنہ ایسوسی ایشن کی جانچ کی ہے۔

پارکنسنز کا مرض ایک اعصابی عارضہ ہے جو اکثر لوگوں کے جسم کو حرکت دینے کی صلاحیت کو متاثر کرتا ہے لیکن بہت سے لوگ یہ نہیں جانتے ہوں گے کہ پارکنسنز کی بیماری لوگوں کی یادداشت کو بھی متاثر کر سکتی ہے۔ اگرچہ یہ کچھ لوگوں کو پریشان کر سکتا ہے، کچھ چیزیں ہیں جو ہم اپنی یادداشت کو بہتر بنانے اور اپنی جسمانی اور ذہنی صحت کو برقرار رکھنے کے لیے کر سکتے ہیں۔

پہلے، پارکنسنز کی بیماری اور یادداشت کے درمیان تعلق کو سمجھیں۔ پارکنسن کی بیماری بنیادی طور پر اعصابی بافتوں کو تباہ کرتی ہے، خاص طور پر ڈوپامائن نیوران، جو جسم کی موٹر کوآرڈینیشن کے لیے اہم ہیں۔ ایک ہی وقت میں، ڈوپامائن نیوران ہماری علمی صلاحیتوں پر بھی اثر انداز ہوتے ہیں، بشمول توجہ، ورکنگ میموری، اور ایگزیکٹو فنکشن۔ لہذا، پارکنسن کی بیماری کی نشوونما کے ابتدائی مرحلے میں، یادداشت میں کمی کی علامات ہوسکتی ہیں، جو بتدریج خراب ہوتی جائیں گی۔

دوسرا، ہمیں اچھی یادداشت کو برقرار رکھنے کا طریقہ سمجھنا چاہیے۔ اگرچہ پارکنسن کی بیماری تشویشناک ہو سکتی ہے، لیکن ایسے طریقے ہیں جن سے ہم اچھی یادداشت کو برقرار رکھنے میں مدد کر سکتے ہیں۔ مثال کے طور پر، اچھی نیند، متوازن خوراک، اعتدال پسند ورزش، اور نئی چیزوں کا مسلسل سیکھنا جیسے اقدامات ہمیں اچھی یادداشت کو برقرار رکھنے میں مدد دے سکتے ہیں۔ اس کے علاوہ، سماجی کاری کو بھی اچھی علمی تربیت کے طور پر دکھایا گیا ہے جو دماغ کے اعصابی افعال کی باقاعدہ تربیت کو فروغ دیتا ہے۔

آخر میں، ہمیں مثبت رویہ رکھنا چاہیے۔ اگرچہ پارکنسن کی بیماری کسی شخص کے جسمانی اور علمی فعل کو متاثر کر سکتی ہے، ہمیں اسے اپنی زندگی کا بنیادی مرکز نہیں بننے دینا چاہیے۔ اس کے بجائے، ہمیں ہمیشہ ایک مثبت رویہ برقرار رکھنا چاہیے اور اپنے دنوں کو ہر ممکن حد تک مکمل اور محبت بھرا رکھنا چاہیے۔

مختصراً، پارکنسنز کی بیماری کا تعلق یادداشت سے ہے، لیکن ہم کچھ تدابیر اور طریقوں کے ذریعے اچھی یادداشت کو برقرار رکھنے میں مدد کر سکتے ہیں۔ اس کے علاوہ ہمیں مختلف چیلنجوں سے بہتر طریقے سے نمٹنے کے لیے مثبت رویہ بھی برقرار رکھنا چاہیے۔ اس نقطہ نظر سے ہمیں اپنی یادداشت کو بہتر بنانے کی ضرورت ہے۔ Cistanche یادداشت کو نمایاں طور پر بہتر بنا سکتا ہے، کیونکہ Cistanche نیورو ٹرانسمیٹر کے توازن کو بھی کنٹرول کر سکتا ہے، جیسے کہ acetylcholine کی سطح میں اضافہ اور ترقی کے عوامل، جو یادداشت اور سیکھنے کے لیے بہت اہم ہیں۔ اس کے علاوہ، گوشت خون کے بہاؤ کو بھی بہتر بنا سکتا ہے اور آکسیجن کی ترسیل کو فروغ دے سکتا ہے، جو اس بات کو یقینی بنا سکتا ہے کہ دماغ کو مناسب غذائیت اور توانائی ملے، اس طرح دماغ کی طاقت اور برداشت کو بہتر بنایا جا سکتا ہے۔

یادداشت کو بڑھانے کے لیے سپلیمنٹس جاننے پر کلک کریں۔

چھ ٹیسٹ شدہ SNPs میں سے، ہم نے صرف rs708727 کی نشاندہی کی ہے جو سلوواکس میں PD شروع ہونے کے بڑھتے ہوئے خطرے سے وابستہ ہے۔ RSS708727 میں معمولی ایلیل (A) غالب اور مکمل طور پر زیادہ غالب جینیاتی ماڈلز میں PD سے وابستہ ہے (ORD=1.36 (1.05–1.77)، p=0.02، اور ORCOD {{11 }}.34 (1.04–1.72)، صفحہ=0.02)۔ مزید برآں، جین ٹائپک ٹرپلٹ GG(rs708727) + AG(rs823156) + CC(rs61822602) طبی لحاظ سے متعلقہ ہوسکتا ہے باوجود اس کے کہ درمیانی (h سے بڑا یا 0.5 کے برابر) سائز کا فرق (h=0.522) ظاہر ہوتا ہے۔ PD اور کنٹرول آبادی۔

RandomForest ماڈلنگ نے PD مریضوں کے درمیان امتیاز کرنے اور بنیادی طور پر صفر ہونے کے کنٹرول کے لیے ٹیسٹ شدہ SNPs کی طاقت کی نشاندہی کی ہے۔ سلوواک آبادی میں PD کے ساتھ rs708727 کی شناخت شدہ ایسوسی ایشن ہمیں یہ قیاس کرنے کی طرف لے جاتی ہے کہ یہ A1 پولیمورفزم، جو ADlinked جین PM20D1 کے اظہار کے ایپی جینیٹک ریگولیشن میں شامل ہے، PD کی پیتھو بیالوجی میں بھی شامل ہے (یا عالمگیر طور پر نیوروڈیجنریشن میں) اسی یا اسی طرح کے طریقہ کار کے ذریعے جیسا کہ AD میں تھا۔

مطلوبہ الفاظ:

پارکنسنز کی بیماری؛ ایک دماغی مرض کا نام ہے؛ پارک 16; Na+/Mg2+ ایکسچینجر؛ SLC41A1; واحد نیوکلیوٹائڈ پولیمورفزم۔

1. تعارف

پارکنسنز کی بیماری (PD) کی پیتھوفیسولوجی میں میگنیشیم (Mg) ہومیوسٹاسس (MgH) کا کردار جاری تحقیق اور بحث کا موضوع ہے۔ سیلولر فزیالوجی میں اور جاندار کی سطح پر Mg کی کارروائیوں کی وسیع رینج اس مفروضے کو ثابت کرتی ہے جس نے MgH کو پریشان کیا ہے PD سے وابستہ انحطاطی عمل میں معاون ہے۔

میگنیشیم سیلولر انرجیٹکس [1,2] کے لیے ضروری ہے۔ یہ ATP کی پیداوار، اس کی ساخت کے استحکام، اور اس کی حیاتیاتی سرگرمی [1-3] کے لیے ضروری ہے۔ مجموعی طور پر، یہ مائٹوکونڈریا کی ساختی تنظیم سے لے کر مائٹوکونڈریل سانس کے مختلف عملوں تک مختلف سطحوں پر مائٹوکونڈریل ہومیوسٹاسس (MH) میں مداخلت کرتا ہے [1–6]۔

MgH اور MH کے درمیان قریبی تعلق کو سیل [7] میں Mg2+ کے مرکزی ذخائر کے طور پر کام کرنے والے مائٹوکونڈریا سے بھی واضح کیا گیا ہے۔ مزید برآں، ایم جی میں اینٹی اپوپٹوٹک، پرو پرولیفیریٹو، اور پرو گروتھ خصوصیات ہیں، اور ایم جی ہومیوسٹٹک مشینری کے اجزاء سیلولر اکٹ/پی کے بی اور ایرک 1/2 پرو سروائیول سگنلنگ [8–10] میں مداخلت کرتے ہیں۔

نیوروڈیجینریٹیو بیماریاں، بشمول PD، سیلولر سطح پر MH کو پہنچنے والے نقصان اور خلیے کی توانائی کے استحکام کو نمایاں کرتی ہیں جس کے نتیجے میں بنیادی طور پر غیر متزلزل مائٹوفجی، ER- تناؤ کا انتظام، ریٹرومر فنکشن، ubiquitination، اور ملحقہ پروٹین ٹرن اوور، یعنی ایسے عمل ہوتے ہیں۔ عام جسمانی حالات میں مضبوطی سے جڑا ہوا ہے [11-13]۔

ان عملوں میں ایم جی کا کردار صرف معمولی سمجھا جاتا ہے۔ اس کے باوجود، دونوں سائٹوپلاسمک پول (بنیادی طور پر coenzyme TRPM7 کے ذریعے محفوظ) اور Mg2+ کے انٹرامائٹوکونڈریل/میٹرکس پول (سپر کنڈکٹیو Mg2+ آئن چینل Mrs2 کے ذریعے محفوظ) کو خاص طور پر اہم سمجھا جاتا ہے۔ اندرونی مائٹوکونڈریل جھلی (∆ψm) [2,4–6] پر جھلی کی صلاحیت کی دیکھ بھال۔

میٹرکس کا کوئی بھی قطرہ [Mg2+} جو خلیوں کی Mg-بھوک کی وجہ سے منسوب ہوتا ہے، یا Mrs2 کی خرابی، ایک غیر پولرائزیشن کو اکساتا ہے جو مزید mitophagy کو متحرک کرتا ہے [14]۔ حال ہی میں، زاؤ اور ساتھیوں نے یہ ظاہر کیا ہے کہ ہائی گلوکوز انٹرا سیلولر [Mg2+] کی ایک بوند کو اکساتی ہے جس کے ساتھ hFOB1.19 خلیوں میں mitophagy کی شمولیت ہوتی ہے (مشروط طور پر لافانی فیٹل آسٹیو بلوسٹس، ATCC CRL{{7}™ [) 15]۔

سائٹوپلاسمک اور بالواسطہ طور پر Mg2+ کی انٹرا آرگنیل (mitochondrial, ER, Golgi) کی تعداد کا انحصار Mg2+ ٹرانسپورٹرز پر ہے، جو کہ Mg2+ ٹرانسپورٹ سرکٹ تشکیل دیتے ہیں۔ سائٹوپلاسمک جھلی [6]۔ یہ ٹرانسپورٹرز مندرجہ ذیل ہیں: (1) coenzyme TRPM7، اہم سیلولر Mg2+ آمد کا گیٹ وے، اور (2) Na+/Mg2+ ایکسچینجر (NME) SLC41A1 (مزید A1 کہا جاتا ہے) ، اہم سیلولر Mg2+ بہاؤ گیٹ وے [6,16,17]۔

درحقیقت، کارنیل کے گروپ نے قیاس کیا ہے کہ شائع شدہ وبائی امراض کے اعداد و شمار "اس امکان کی حمایت کرتے ہیں کہ MgH سے متعلقہ جینوں میں ہونے والی تبدیلیاں PD کے خطرے کو تبدیل کر سکتی ہیں" لیکن اس بات کی تصدیق کے لیے "PD مریضوں کے گہرے جینیاتی تجزیوں" کی ضمانت دیتا ہے کہ SLC41A1 (مزید A1 کے طور پر کہا جاتا ہے) اور TM7۔ ان جینز میں شامل ہیں [18]۔

PD کے شروع ہونے اور بڑھنے میں NME A1 کی ممکنہ شمولیت کے بارے میں، Tucci اور ساتھیوں نے جینز کے دو نئے کوڈنگ قسموں کی نشاندہی کی ہے جو PARK16 لوکس سے ہیں اور جو صرف PD کوہورٹ میں موجود ہیں، یعنی RAB7L1 (c.470A > G ; p.K157R) اور A1 (c.1049C > T, p.A350V) [19]۔ Kolisek کے سابق گروپ نے A1 c.1049C > T کو فنکشن اتپریورتن کے ایک فائدے کے طور پر نمایاں کیا ہے جس کے نتیجے میں "A1 ویرینٹ p.A350V کے ذریعہ کئے گئے Mg2+- بہاؤ کو بڑھایا جاتا ہے"، جو طویل مدتی میں، "دائمی انٹرا سیلولر Mg2+ - کی کمی، ایک ایسی حالت جو PD کے مریضوں کے دماغ کے مختلف علاقوں میں پائی جاتی ہے اور جو اعصابی نقصان کو متحرک کرنے والے عمل کو بڑھا دیتی ہے" [20]۔

لن وغیرہ۔ بعد ازاں 80 مریضوں کے گروپ میں A1 p.R244H کے فنکشن ویرینٹ کے غیر معمولی نقصان کی نشاندہی کی ہے جن کی ابتدائی شروعات PD [21] کی تشخیص ہوئی ہے۔ A1 کے فنکشن کے نقصان کے پیچھے طریقہ کار قیاس آرائی کا معاملہ ہے، حالانکہ تاتارکووا اور ساتھیوں نے حال ہی میں ڈیٹا فراہم کیا ہے جس سے یہ واضح ہوتا ہے کہ "A1 کی موجودگی یا عدم موجودگی، اور اس طرح فعالیت، توانائی کی پیداوار میں شامل مائٹوکونڈریل عمل کو متاثر کرتی ہے"۔ 1]۔ مزید یہ کہ لی اور ساتھیوں نے حال ہی میں A1 ویریئنٹ p.R285Q کو PD [22] کے ساتھ منسلک کیا ہے۔

PD میں A1 کی ممکنہ شمولیت کے مزید تجرباتی ثبوت لن اور ساتھی کارکنوں کے ذریعہ فراہم کیے گئے ہیں جنہوں نے یہ دکھایا ہے کہ Mg سلفیٹ (MgSO4) ممکنہ طور پر SH-SY5Y خلیوں کو 6-hydroxydopamine (6-OHDA) کے نیوروٹوکسائٹی سے بچاتا ہے۔ ) [23]۔ انہوں نے یہ بھی ظاہر کیا ہے کہ 6-OHDA 6-OHDA سے علاج شدہ SH-SY5Y خلیوں میں A1 (اور دیگر میگنیسیوٹروپک جینز) کے اظہار کو کم کرتا ہے، اور یہ کہ MgSO4 اس کی کمی کو ریورس کر سکتا ہے [23]۔ اسی گروپ نے ڈیٹا بھی فراہم کیا ہے جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ، چوہے کے PD ماڈل میں، 6-OHDA A1/A1 (RNA اور پروٹین دونوں سطحوں پر) کے اظہار کو تبدیل کرتا ہے، اور یہ کہ اس تبدیلی کی حد [ MgSO4] [23]۔

PARK16 لوکس پانچ جینوں پر مشتمل ہے، یعنی SLC45A3، NUCKS1، RAB7L1، A1، اور PM20D1 [24]۔ PD کی حساسیت میں اس کے کردار کی نشاندہی متعدد جینوم وائیڈ ایسوسی ایشن اسٹڈیز (GWAS) اور کیس کنٹرول اسٹڈیز نے کی ہے۔ تین A1 سنگل نیوکلیوٹائڈ پولیمورفزم (SNP(s)) کا PD کے ساتھ ان کی وابستگی کے بارے میں بڑے پیمانے پر مطالعہ کیا گیا ہے۔

چین میں ہان گروہ کے A1 پولیمورفزم rs11240569 (خصوصیات کے لیے جدول 1 دیکھیں) کے بڑے G ایلیل کو idiopathic PD کے خطرے کو کم کرنے کے لیے دکھایا گیا ہے، جن لوگوں کے پاس GG اور AG جین ٹائپس ہیں ان کے مقابلے میں کم خطرہ ظاہر ہوتا ہے۔ AA جین ٹائپ ہے [25]۔ اسی طرح کا نتیجہ ایک ایرانی گروہ کے ساتھ کی گئی ایک تحقیق میں حاصل ہوا ہے [26]۔

ایک اور A1 SNP، rs708727 (ٹیبل 1) کا مطالعہ برطانیہ کے ایک گروپ میں کیا گیا ہے، لیکن اس SNP اور PD کے درمیان کوئی تعلق نہیں پایا گیا ہے [19]۔ تاہم، اس SNP کو الزائمر کی بیماری (AD) سے منسلک کیا گیا ہے [27]۔

PD کے بارے میں، rs823156 (ٹیبل 1)، شاید سب سے زیادہ شدت سے مطالعہ کیا گیا ہے لیکن A1 SNPs میں سب سے زیادہ متنازعہ بھی ہے۔ یہ SNP مین لینڈ چین [28]، جاپان [29]، اور کوریا [30] سے تعلق رکھنے والے گروہوں میں PD کے ساتھ منسلک ہے، لیکن مشرقی چین [31]، اسپین کے شمال [32]، اور ملائیشیا [33] کے گروہوں میں نہیں ہے۔ ] بائی اور ساتھیوں نے سلیکو کے تجزیوں کے بعد پیش گوئی کی ہے کہ rs823156 A1 کے نان کوڈنگ ویرینٹ کے طور پر "جینز کی ٹرانسکرپشن فیکٹر بائنڈنگ کی صلاحیت کو تبدیل کرکے PD کے خطرے کو متاثر کر سکتا ہے" [34]۔

پہلے شائع شدہ کام نے یہ واضح کر دیا ہے کہ خلیے پروٹین کی سطح اور نقل کی سطح [17,20,35,36] پر A1 کے ذریعے Mg2+ بہاؤ کی حد کو کنٹرول کرتے ہیں۔ تاہم، A1 کے پروموٹر کی تنظیم کے بارے میں معلومات کی مقدار اور اس کی ٹرانسکرپشن بائنڈنگ کی صلاحیت بہت کم ہے [34]۔

2019 میں، ہم نے ایک مطالعہ شائع کیا جس میں دکھایا گیا ہے کہ مذکورہ بالا تین A1 SNPs سلوواک آبادی میں PD کی طرف کسی بھی حساسیت سے وابستہ نہیں ہیں، جیسا کہ فریکوئنٹیسٹ شماریات اور مشین لرننگ [37] کے ذرائع سے ظاہر ہوتا ہے۔ اس مطالعے کی ایک بڑی حد PD (150) اور کنٹرول (120) دونوں جماعتوں میں شرکاء کی نسبتاً کم تعداد ہو سکتی ہے۔

لہذا، اس مطالعہ کا مقصد دوگنا ہے، جیسا کہ: (1) PD مریضوں (150 + 358) اور کنٹرول پروبینڈز ({{5) کے ایک بڑے گروپ میں rs11240569، rs708727، اور rs823156 کی کسی بھی ممکنہ ایسوسی ایشن کو واضح کرنا۔ }})، اور (2) پروموٹر ریجن کے اندر کسی بھی ممکنہ SNPs کی شناخت کرنے اور PD کے ساتھ ان کی ممکنہ وابستگی کی جانچ کرنے کے لیے PD نمونوں کے ذیلی گروہ میں A1 کے فروغ دینے والے علاقے کو ترتیب دینے کے لیے۔

2. نتائج

2.1 SLC41A1 پروموٹر ریجن کی ترتیب

سینجر کی ترتیب اور ترتیب کا تجزیہ 96 PD مریضوں (تمام مارٹن کے PD سینٹر سے) کے ذیلی گروہ میں کیا گیا تھا۔ A1 فروغ دینے والے خطے کے ایک ٹکڑے کا مطالعہ کیا گیا، جو کروموسوم ون پر 205,814,626 سے 205,812,988 تک پھیلا ہوا ہے۔ ٹکڑے کی ترتیب کا انتخاب جینیکوپویا ڈیٹا بیس [www.genecopoeia.com/ product/search/view_seq_promoter.php?cid=&type{{12} کے مطابق کیا گیا تھا۔ }پروموٹر اور پروڈ_id=HPRM53412 (2 مئی 2018 کو رسائی)]۔

A1 کی جین تنظیم اور اس کے پروموٹر/ریگولیٹری ترتیب کو شکل 1 میں دکھایا گیا ہے۔ ترتیب نے A1 پروموٹر کے علاقے میں درج ذیل چار SNPs کی شناخت کی اجازت دی: rs9438393, rs56152218, rs61822602, اور rs1414F (rs141402)۔ اس کے بعد، ہم نے RFLP حکمت عملی کو 100 کنٹرول نمونوں کے ذیلی گروپ میں rs9438393 (Hpy166II کے ساتھ پابندی)، rs56152218 (NIaIII کے ساتھ پابندی)، اور rs61822602 (BmrI کے ساتھ پابندی) کی جانچ کرنے کے لیے استعمال کیا۔ مناسب پابندی والے انزائم کی کمی کی وجہ سے کنٹرول گروپ میں SNP rs144056491 کی جانچ نہیں کی گئی۔

ConSite [38] (ٹیبل 2)، جینومک ترتیب میں cis-ریگولیٹری عناصر کو تلاش کرنے کے لیے ایک ویب پر مبنی ٹول، کو یہ جانچنے کے لیے استعمال کیا گیا تھا کہ آیا مذکورہ بالا چار SNPs میں سے ہر ایک کے لیے متغیر (معمولی) ایلیل نے TF- بائنڈنگ پروفائل کو تبدیل کیا ہے۔ A1 پروموٹر ایک نئی TF بائنڈنگ سائٹ پیش کر کے یا موجودہ کو مٹا کر۔ ان پٹ کے طور پر، ہم نے 33 bp لمبے تسلسل کا استعمال کیا، ایک حوالہ (بڑی) ایللی کے ساتھ اور دوسرا ہر SNP کے لیے متغیر (معمولی) ایلیل کے ساتھ، بالترتیب۔

rs144056491 پر، جو ٹرانسکرپشن فیکٹر p50 کی بائنڈنگ سائٹ کے اندر واقع ہے، دونوں بڑے ایلیل (C) اور معمولی ایلیل (-، CC، CCC) ممکنہ طور پر اس ٹرانسکرپشن فیکٹر (شکل 1) کے پابند ہونے کی اجازت دیتے ہیں۔ RSS9438393 پر میجر ایلیل (A) کی موجودگی ٹرانسکرپشن فیکٹر FREAC-4 (ٹیبل 2، شکل 1) کے پابند ہونے کی اجازت دے سکتی ہے۔ تاہم، اگر معمولی ایلیل (G) موجود ہے، تو FREAC-4 بائنڈنگ سائٹ کو TF- بائنڈنگ پیش گوئی کرنے والے سافٹ ویئر کے ذریعے مزید تسلیم نہیں کیا جائے گا۔ اسی SNP میں، معمولی ایلیل SP1 کے پابند ہونے کی اجازت دیتا ہے، جو کہ بڑے ایلیل کی موجودگی میں ایسا نہیں ہے (ٹیبل 2، شکل 1)۔

rs56152218 پر موجود میجر ایلیل (T) قطعی طور پر Gata2 کے پابند ہونے کی اجازت دیتا ہے، لیکن پیشین گوئی کے مطابق، معمولی ایلیل (C) کی موجودگی میں ایسا نہیں ہوگا۔ دوسری طرف، YY1 معمولی C-allelic متغیر کو باندھ سکتا ہے، لیکن اہم T-allelic متغیر کو نہیں (ٹیبل 2، شکل 1)۔ ان سلیکو پیشین گوئی کے مطابق، SNP rs61822602 کسی بھی TF- پابند ترتیب (ٹیبل 2، شکل 1) کے اندر واقع نہیں ہے۔

شکل 1. A1 کی جین تنظیم بشمول ملحقہ اپ اسٹریم 50UTR۔ Ensembl ٹرانسکرپٹ: SLC41A1-201 ENST00000367137.4 کے مطابق، یہ جین کروموسوم 1 پر واقع ہے اور 11 exons پر مشتمل ہے۔ Exon 1 50UTR (غیر ترجمہ شدہ خطہ) کی نمائندگی کرتا ہے، اور exon 2 اس 50UTR کا ایک حصہ پر مشتمل ہے۔ 3 0UTR کو exon 11 میں شامل کیا گیا ہے۔ ہمارے پچھلے مطالعے میں، ہم نے A1 میں تین SNPs (سنگل نیوکلیوٹائڈ مختلف حالتوں) کا مطالعہ کیا، یعنی rs11240569، rs708727، اور rs823156 A1 [37] میں۔ اس کام میں، ہم نے اس جین کے اوپری حصے میں واقع ایک ترتیب (لمبائی میں 1638 bp) کا تجزیہ کیا۔

یہ ترتیب 50 اپ اسٹریم ترتیب اور جزوی طور پر ایکسون 1 کا احاطہ کرتی ہے۔ UCSC جینوم براؤزر [39] کے مطابق، یہ ترتیب ایک ریگولیٹری خطہ ہے جس کی نمائندگی CpG جزائر (سبز مستطیل) کرتی ہے۔ ایک پروموٹر نما دستخط (EH38E1415811) اور ایک قربت بڑھانے والے نما دستخط (EH38E14112) (بالترتیب سرخ اور نارنجی مستطیل) اس خطے میں بیان کیے گئے ہیں۔

ہم نے اس ترتیب میں چار SNPs (rs144056491, rs61822602, rs56152218, اور rs9438393) کی نشاندہی کی ہے۔ rs144056491 پر، حوالہ ترتیب کے اندر اور پھر متغیر کے ساتھ ترتیب میں تلاش کے نتیجے میں ٹرانسکرپشن فیکٹر p50 کے لیے بائنڈنگ سائٹ کی شناخت ہوئی۔ rs9438393 پر، تلاش کے نتیجے میں ٹرانسکرپشن فیکٹر FREAC-4 (اے ایلیل) کے لیے بائنڈنگ سائٹ کی شناخت ہوئی۔ تاہم، متغیر ترتیب (G ایلیل) میں کسی پابند سائٹ کا پتہ نہیں چلا۔ اسی SNP میں، G ایلیل SP1 کے پابند ہونے کی اجازت دیتا ہے۔ rs56152218 پر، غالب T ایلیل Gata2، اور معمولی ایلیل جو YY1 کا پابند ہے۔

For more information:1950477648nn@gmail.com