رینل سیل کارسنوما کے مریضوں میں ٹیومر ڈی این اے کی گردش۔ ادب کا ایک منظم جائزہ
Nov 07, 2023
3.3 ٹیومر ٹشو کے ساتھ ہم آہنگی
سی ٹی ڈی این اے تجزیہ کی ممکنہ ایپلی کیشنز میں سے ایک جینیاتی ہیٹروجنیٹی پر قابو پانے کی صلاحیت ہے۔ جینیاتی متفاوت خلاء (مقامی) اور وقت (دنیاوی) میں پایا جاتا ہے، اور کینسر کے انتظام میں کافی چیلنج پیش کرتا ہے۔ مقامی تفاوت بنیادی ٹیومر کے علاقوں/سب کلونز یا میٹاسٹیٹک گھاووں میں جینیاتی خرابیوں کی موجودگی ہے۔ اگر متضاد ہونے کی وجہ سے بنیادی ٹیومر سے بایپسی ٹشو میں ہدف کے قابل خرابیاں موجود نہیں ہیں، تو وہ نامعلوم رہیں گے اور ممکنہ طور پر مریض کے سب سے زیادہ علاج کا باعث بنیں گے۔ ٹیومر کے کلونل ارتقاء کے نتیجے میں وقت کے ساتھ ساتھ وقتی متفاوت پیدا ہوتا ہے، جو بیماری کے نظامی علاج یا ٹیومر کے جینومک عدم استحکام کی وجہ سے منتخب دباؤ کی وجہ سے ہو سکتا ہے۔
اسمتھ ایٹ ال [16] نے ایک وسیع پیمانے پر خصوصیت والے مریض میں دس مقامی طور پر الگ الگ ٹیومر ٹشو کے نمونوں کے ساتھ ہیٹروجنیٹی تجزیہ کیا اور مشاہدہ کیا کہ دس میں سے نو ٹیومر والے خطوں کے علاقے سے متعلق تغیرات کی پلازما میں نشاندہی کی گئی تھی، اس طرح یہ ظاہر ہوتا ہے کہ سی ٹی ڈی این اے تجزیہ ٹیومر ہیٹروگ پر قابو پا سکتا ہے۔
گردے کے لیے Cistanche کی ہربل فارمولیشن حاصل کرنے کے لیے یہاں کلک کریں
جینیاتی تفاوت پر قابو پانے کے لیے ctDNA کی ممکنہ صلاحیت کو دریافت کرنے کا ایک اور طریقہ یہ ہے کہ ایک ہی مریض سے پلازما کے نمونے اور ایک ہی ٹشو بایپسی کے درمیان ہم آہنگی کی چھان بین کی جائے۔ بیکن ایٹ ال [23] نے اس نقطہ نظر کو استعمال کیا اور ٹیومر ٹشو کے دستیاب نمونوں کے ساتھ چار ctDNA-مثبت مریضوں میں 77% کی ہم آہنگی پائی۔ ہان ایٹ ال [19] نے صرف 8.6٪ کی ہم آہنگی پائی۔ تاہم، شاید اس کی وجہ یہ ہے کہ اس مریض کے گروپ میں پلازما کے نمونے متعلقہ ٹیومر ٹشو کے نمونوں (یعنی 22 ماہ، رینج 0–70) کے کئی مہینوں بعد اور کچھ بار پرائمری ٹیومر کے سرجیکل ریسیکشن کے بعد جمع کیے گئے تھے۔ ٹشو اور پلازما کے نمونے جمع کرنے کے درمیان وقت کے مطابق مریضوں کی سطح بندی نے ٹیومر ٹشو اور پلازما جمع کرنے کے درمیان 6 ماہ والے مریضوں کے لیے کنکور ڈانس کی شرح کو تھوڑا سا بڑھا کر 11.4 فیصد کر دیا۔ یہ وقت کے ساتھ ساتھ ٹیومر کے کلونل ارتقاء کی طرف اشارہ کرتا ہے، جو مختلف ٹائم پوائنٹس پر جمع کردہ ٹیومر ٹشو اور پلازما کے نمونوں کے درمیان کم ہم آہنگی کی وضاحت کرے گا۔ اس مفروضے کی تائید پال ایٹ ال [21] کے مطالعے کے نتائج سے ہوتی ہے جس میں 13 مریضوں نے ایک سے زیادہ نمونوں پر سی ٹی ڈی این اے کا تجزیہ کیا تھا، دوسرا نمونہ پہلے کے بعد 157 ڈی (رینج 21–360) کے اوسط پر حاصل کیا گیا تھا۔ . پہلے اور دوسرے نمونوں میں پائی جانے والی خرابیوں کے درمیان ہم آہنگی نمونہ جمع کرنے کے درمیان بڑھتے ہوئے وقت کے ساتھ کم ہوئی، اس طرح ٹیومر کے کلونل ارتقاء کی نشاندہی ہوتی ہے۔
3.4 تشخیص اور بیماری کی نگرانی
سی ٹی ڈی این اے تجزیہ کی ممکنہ ایپلی کیشنز میں سے ایک پروگنوسٹک معلومات فراہم کرنے کی صلاحیت ہے، جس کی چار مطالعات میں تحقیق کی گئی تھی۔ جنگ ایٹ ال، لن ایٹ ال، اور یاماموتو وغیرہ نے پایا کہ آر سی سی کے مختلف مراحل والے مریضوں میں سی ٹی ڈی این اے کا پتہ لگانا یا تو موت کے زیادہ خطرے سے وابستہ تھا [31]، یا کم ترقی سے پاک بقا [22,30]، کینسر سے متعلق مخصوص بقا [22]، یا مجموعی طور پر بقا [30]۔ بیکن ایٹ ال [23] نے پایا کہ ctDNA-مثبت مریضوں کی مجموعی طور پر بقا اور ctDNA-منفی مریضوں کے مقابلے میں پہلی لائن تھراپی پر ترقی سے پاک بقا ہے۔ مزید مطالعات کی ضرورت ہے، لیکن یہ نتائج بتاتے ہیں کہ سی ٹی ڈی این اے میں پروگنوسٹک بائیو مارکر کی صلاحیت ہو سکتی ہے۔
سی ٹی ڈی این اے تجزیہ کا ایک اور ممکنہ اطلاق نظامی علاج اور مریضوں کی پیروی کے دوران بیماری کی نگرانی میں ہے۔ چار مطالعات [16,18,21,22] نے مریضوں کے طولانی نمونے لینے اور عام طور پر پایا کہ بیماری کے کلینیکل کورس سے ctDNA کی سطح میں اتار چڑھاؤ آتا ہے۔ Smith et al [16] نے 37 مریضوں کے 252 طول بلد نمونوں کا تجزیہ کیا۔ انہوں نے مشاہدہ کیا کہ علاج شروع کرنے سے پہلے سی ٹی ڈی این اے کی سطح میں اضافہ ہوا، علاج کے ردعمل کے ساتھ کم ہوا، اور بیماری کے بڑھنے یا علاج کے ردعمل کی کمی کے ساتھ اضافہ یا بلند رہا۔ Lasseter et al [18] اور Yamamoto et al [22] کے مطالعے، جنہوں نے بالترتیب پانچ اور چھ مریضوں کے طول البلد نمونوں میں ctDNA کی سطح کی چھان بین کی، Smith et al کی رپورٹ کردہ نتائج کی تائید کرتی ہے۔ اس طرح یہ مطالعات اس تصور کی تائید کرتے ہیں کہ سی ٹی ڈی این اے ممکنہ طور پر علاج کے ردعمل اور بیماری کے بڑھنے کی نگرانی کے لیے موزوں بائیو مارکر ہو سکتا ہے۔
3.5 تھراپی اور سی ٹی ڈی این اے کی لائن
دو مطالعات [21,24] نے سی ٹی ڈی این اے میں جینیاتی خرابیوں پر پہلی لائن اور بعد کی لائن تھراپی کے اثر کی تحقیقات کی۔ پال ایٹ ال [21] نے 220 مریضوں کا ایک بڑا مطالعہ کیا جس میں پہلی سطر اور دوسری یا بعد میں نظامی علاج حاصل کرنے والے مریضوں کے درمیان جینیاتی تبدیلیوں میں پائے جانے والے فرق کی تحقیقات کی گئیں۔ انہوں نے پایا کہ درمیانی VAF پہلی لائن علاج حاصل کرنے والے مریضوں کے لئے 20٪ تھا لیکن بعد میں علاج حاصل کرنے والے مریضوں کے لئے 24٪ تک بڑھ گیا۔ مزید برآں، انہوں نے پہلی لائن تھراپی حاصل کرنے والے مریضوں اور بعد میں لائن تھراپی حاصل کرنے والوں کے درمیان متعدد جینوں کے لیے مختلف تغیرات کی تعدد کا مشاہدہ کیا۔ Zhang et al [24] نے پایا کہ ctDNA میں جینیاتی خرابیوں کی تعداد موصول ہونے والی تھراپی کی لائنوں کی تعداد سے وابستہ تھی۔ دو مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ سی ٹی ڈی این اے کا نظامی علاج کے دوران حاصل ہونے والی جینیاتی خرابیوں کی نشاندہی کرنے میں ایک کردار ہوسکتا ہے اور ممکنہ طور پر علاج کی مزاحمت کے طریقہ کار کی شناخت کا طریقہ فراہم کرسکتا ہے۔
3.6۔ سی ٹی ڈی این اے کا پتہ لگانے کے طریقے: کون سا انتخاب کرنا ہے؟
ctDNA اکثر صحت مند خلیوں سے جاری ہونے والے cfDNA کے پس منظر کے خلاف منٹ کی مقدار میں موجود ہوتا ہے۔ کم سی ٹی ڈی این اے کی سطح کو پتہ لگانے کے لیے انتہائی حساس طریقوں کی ضرورت ہوتی ہے، خاص طور پر آر سی سی میں، جس میں عام طور پر دیگر کینسروں کے مقابلے میں سی ٹی ڈی این اے کی سطح کم دکھائی دیتی ہے۔ اس لیے طریقوں کا موازنہ اور اصلاح انتہائی اہمیت کی حامل ہے۔
دو مطالعات نے ctDNA کا پتہ لگانے کے لیے مختلف طریقوں کا موازنہ کیا۔ Smith et al [16] نے دو مختلف RCC مریضوں کے ساتھ تین طریقوں کا اطلاق کیا؛ ٹیومر گائیڈڈ تجزیہ، ٹارگٹڈ پینل کی ترتیب، اور پلازما کی عالمی ترتیب۔ انہوں نے پایا کہ ٹیومر کی رہنمائی والے تجزیہ میں سی ٹی ڈی این اے کا پتہ لگانے کی شرح سب سے زیادہ تھی، جبکہ پلازما کی عالمی ترتیب سب سے کم تھی۔ اس تلاش کی حمایت لیسیٹر ایٹ ال [18] کے ذریعہ کئے گئے مطالعہ سے ہوتی ہے، جس نے ایک واحد RCC مریض کے گروہ میں ctDNA کا پتہ لگانے کے لئے تین طریقوں کا بھی اطلاق کیا: عالمی میتھیلیشن تجزیہ (cfMeDIP-seq)، ٹیومر کی رہنمائی کا تجزیہ، اور ہدف شدہ پینل کی ترتیب۔ پلازما کی. انہوں نے پایا کہ cfMeDIP-seq نے بہترین کارکردگی کا مظاہرہ کیا اور ٹیومر کی رہنمائی کرنے والا تجزیہ ہدف والے پینل کی ترتیب سے زیادہ حساس تھا۔ cfMeDIP-seq کی برتری کی ایک تجویز کردہ وجہ یہ تھی کہ RCC [34] میں جینیاتی تغیرات سے ایپی جینیٹک خرابیاں زیادہ کثرت سے ہوتی ہیں۔
متعدد مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ RCC میں ctDNA تجزیہ کی حساسیت کو چھوٹے DNA کے ٹکڑوں کی افزودگی سے بہتر بنایا جا سکتا ہے۔ Mouliere et al [25] نے پلازما کا WGS انجام دیا اور پایا کہ 90 اور 150 bp کے درمیان DNA کے ٹکڑوں کے انتخاب سے کینسر کی کئی اقسام میں ctDNA کا پتہ لگانے کی شرح بہتر ہوئی ہے، جس کی تائید اسمتھ ایٹ ال [16] کے ذریعہ رپورٹ کردہ نتائج سے ہوتی ہے۔ ان کا مطالعہ sWGS اور ٹیومر گائیڈڈ ترتیب تجزیہ کا استعمال کرتے ہوئے۔ Yamamoto et al [22] نے ٹارگٹڈ پینل کی ترتیب سے حاصل کردہ ڈیٹا کا استعمال کرتے ہوئے cfDNA ٹکڑے کی لمبائی کا تجزیہ کیا اور پایا کہ تغیرات کے ساتھ DNA کے ٹکڑے متعلقہ غیر تبدیل شدہ ٹکڑوں سے چھوٹے ہوتے ہیں اور اسی طرح مثبت ctDNA تجزیہ والے مریضوں میں مختصر کے مقابلے میں زیادہ تناسب ہوتا ہے۔ طویل ٹکڑے. ان مطالعات کے نتائج ایک ساتھ بتاتے ہیں کہ ٹکڑے کے سائز کا تجزیہ بھی ctDNA کی مخصوص سطحوں والے نمونوں کی شناخت کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے تاکہ بہت کم ctDNA کی سطح والے نمونوں پر مہنگے تجزیے سے بچ سکیں۔
اس بارے میں بہت سی ممکنہ وضاحتیں ہیں کہ شامل مطالعات میں ctDNA کا پتہ لگانے کی شرح 100% سے کم کیوں ہے۔ یہ پتہ لگانے کے لیے استعمال کیے جانے والے طریقوں یا تجزیہ سے متعلق دیگر عوامل کی حساسیت کی وجہ سے ہو سکتا ہے، مثال کے طور پر، اگر ٹیومر کے تغیرات کی نشاندہی کی گئی تھی تو وہ سب کلونل تھے اور صرف ٹیومر کے ایک چھوٹے سے حصے میں موجود تھے [35]۔ دیگر ممکنہ وجوہات کینسر کی قسم ہیں، ٹیومر کی جسمانی جگہ خون کی بجائے پیشاب میں ctDNA کا باعث بنتی ہے، ٹیومر کا DNA دوسرے ٹیومر کے مقابلے میں تیزی سے صاف ہوتا ہے، یا صرف یہ کہ گردوں کے ٹیومر دوسرے ٹیومر کے مقابلے میں کم DNA بہاتے ہیں [15] . ایک آسان حل یہ ہو سکتا ہے کہ پلازما کی زیادہ مقدار سے ڈی این اے کا تجزیہ کیا جائے۔ تاہم، یہ متناسب طور پر زیادہ تر معاملات میں تجزیہ کی لاگت میں اضافہ کرے گا۔ ہم امید کرتے ہیں کہ مستقبل کے مطالعے ان میں سے کچھ سوالات پر روشنی ڈالیں گے اور RCC میں ctDNA کا پتہ لگانے کی صلاحیت کو بہتر بنائیں گے۔
4. نتائج
RCC مریضوں میں ctDNA کی تحقیقات کرنے والے مطالعات کی تعداد اب بھی کم ہے اور ان مطالعات میں شامل مریضوں کی تعداد محدود ہے، حالانکہ پچھلے کچھ سالوں میں بڑے مطالعے سامنے آئے ہیں۔ مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ آر سی سی میں سی ٹی ڈی این اے کی سطح کم دکھائی دیتی ہے۔ تاہم، ایم آر سی سی والے مریضوں میں مقامی بیماری والے مریضوں کے مقابلے میں سی ٹی ڈی این اے کی مقدار زیادہ ہوتی ہے۔ سی ٹی ڈی این اے کا پتہ لگانے کے لیے متعدد طریقوں کا استعمال کرتے ہوئے مطالعے سے پتہ چلتا ہے کہ ٹیومر کی رہنمائی کرنے والا تجزیہ غیر رہنمائی طریقوں کے مقابلے میں سی ٹی ڈی این اے کا پتہ لگانے کی شرح کو بہتر بناتا ہے اور تجویز کرتا ہے کہ سی ایف ایم ڈی آئی پی سیک ممکنہ طور پر آر سی سی میں سی ٹی ڈی این اے کا پتہ لگانے کے لیے ایک انتہائی حساس طریقہ ہو سکتا ہے۔ RCC میں ctDNA تجزیہ کی ممکنہ ایپلی کیشنز کا تعین کرنے اور ان ایپلی کیشنز کے طریقوں کو بہتر بنانے کے لیے مزید مطالعات کی ضرورت ہے۔
حوالہ جات
[1] پارکن ڈی ایم، بری ایف، فیرلے جے، پسانی پی. عالمی کینسر کے اعدادوشمار، 2002۔ CA کینسر جے کلین 2005؛ 55(2):74–108۔
[2] Ljungberg B، Albiges L، Bensalah K، et al. EAU رہنما خطوط: رینل سیل کارسنوما 2020 V3-1۔ ارنہم، نیدرلینڈز: یورولوجی کی یورپی ایسوسی ایشن؛ 2020۔ https://uroweb.org/wp-content/ uploads/EAU-Guidelines-on-Renal-Cell-Carcinoma-2020V3.pdf۔
[3] Danske Multidisciplinære Cancer Grupper. Renalcellecarcinomer - پیٹولوجی۔ https://www.dmcg.dk/siteassets/forside/kliniske retningslinjer/godkendte-kr/darenca/darenca_patologi_adm-godk_ jbh100919.pdf۔
[4] Baldewijns MM, van Vlodrop IJH, Schouten LJ, Soetekouw PMMB, de Bruïne AP, van Engeland M. Genetics and epigenetics of renal cell cancer. بائیوکیم بایوفیس ایکٹا 2008؛ 1785:133–55۔
[5] ایلنگر جے، وون روکر اے، باسٹین پی جے، مولر ایس سی۔ گردش کرنے والا سیل فری سیرم ڈی این اے: یورولوجیکل خرابی کے لئے ایک نئے بائیو مارکر کے طور پر اہمیت۔ یورولوج اے 2010؛ 49، 1131-2، 1134۔
[6] Schwarzenbach H, Hoon DS, Pantel K. کینسر کے مریضوں میں بائیو مارکر کے طور پر سیل فری نیوکلک ایسڈ۔ نیٹ ریو کینسر 2011؛ 11:426–37۔
[7] Esposito A، Bardelli A، Criscitiello C، et al. ٹھوس ٹیومر والے مریضوں میں ٹیومر سے ماخوذ سیل فری ڈی این اے کی نگرانی: طبی نقطہ نظر اور تحقیق کے مواقع۔ کینسر کا علاج Rev 2014؛ 40:648–55۔
[8] Fleischhacker M, Schmidt B. گردش کرنے والے نیوکلک ایسڈز (CNAs) اور کینسر – ایک سروے۔ بائیوکیم بایوفیس ایکٹا 2007؛ 1775:181–232۔ [9] ڈی مارٹینو ایم، کلٹی ٹی، ہیٹل اے، ماربرجر ایم. رینل سیل کارسنوما میں سیرم سیل فری ڈی این اے: ایک تشخیصی اور تشخیصی مارکر۔ کینسر 2012؛ 118:82-90۔ [10] Kidess E، Jeffrey SS. گردش کرنے والے ٹیومر سیلز بمقابلہ ٹیومر سے ماخوذ سیل فری ڈی این اے: سنگل سیل تجزیہ کے دور میں کینسر کی دیکھ بھال میں حریف یا شراکت دار؟ جینوم میڈ 2013؛ 5:70۔
Wecistanche کی معاون خدمت - چین میں سب سے بڑا cistanche برآمد کنندہ:
ای میل:wallence.suen@wecistanche.com
واٹس ایپ٪ 2ftel٪3a٪7b٪7b0٪7d٪7d
مزید تفصیلات کے لیے خریداری کریں:
https٪3a٪2f٪2fwww.xjcistanche.com٪2fcistanche-shop
